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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

[交流] 【其他】在线答疑:VASP的问题 已有104人参与

vasp是一个很不错的软件,尤其称道的是他的计算速度和稳定性。
由于wuchenwf版主即将隐退,特开此贴。
本人能力也极其有限,所以在此抛砖引玉,标题虽是答疑,但是我觉得更应该是讨论。大家术业有专攻,VASP的每个方面不可能都掌握。希望和大家也共同进步。

老帖地址(供大家参考)(wuchenwf):http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1740019&fpage=1

老帖地址(供大家参考)(九尾鱼):http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=679096&fpage=1

老帖地址(供大家参考)(wuchenwf):http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1083523
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greatqi

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
一 安装编译器
1. 解压缩pgilinux86-64-702.tar.gz到xc文件夹
2. 手动建立/opt/pgi文件夹
3. 在xc文件夹中输入./install进行安装
4. 将license.dat文件放至/opt/pgi/
5. 设置环境变量:打开/etc/bashrc,在最后面粘贴如下一段:
PATH=/opt/pgi/linux86-64/7.0/bin:$PATH
export PATH
MANPATH=$MANPATH:/opt/pgi/linux86-64/7.0/man
export MANPATH
LM_LICENSE_FILE=/opt/pgi/license.dat
export LM_LICENSE_FILE
export PGI=/opt/pgi
保存
然后在命令行输入source .bashrc
二、 安装数学库:
三、 编译:
1. 输入命令如下:
cd vasp.4.lib
cp makefile. linux_pgi _opt ma kefile
make
成功后将在vasp.4.lib 文件夹中得到libdmy.a文件
2. 退出vasp.4.lib 目录,然后输入命令如下:
cd vasp.4.6
cp makefile. linux_pgi _opt ma kefile
然后编辑makefile 文件:找到# Atlas based libraries所在行后,将其后行做如下修改:
将#ATLASHOME= $(PWD)/Linux_HAMMER64SSE2/lib/行改为:
ATLASHOME= <数学库所在路径>/lib/(没有#)
将#BLAS= -L$(ATLASHOME) -lf77blas –latlas行#去掉
将BLAS= /home/kresse/64/vasp.4.6/libgoto_opt64-r0.93.so行最前端加上#
将LAPACK= ../vasp.4.lib/lapack_double.o行改为
LAPACK= /xxx/vasp.4.lib/lapack_double.o
然后保存退出
然后make

编译成功后将在vasp.4.6文件夹中生成vasp 可执行文件

在即将完成安装的时候,输入make 然后出现以下错误信息。./preprocess xcspin.f90  -DHOST=\"LinuxIFC\" -Dkind8 -DNGXhalf -DCACHE_SIZE=8000 -DPGF90 -Davoidalloc
/bin/sh: xcspin.f90: Permission denied
make: *** [xcspin.f90] Error 1账户

如果我转换成root账户,出现以下信息: [root@scluster vasp.4.6]# make
bash: make: command not found。
请问到底是怎么回事?

[ Last edited by greatqi on 2010-6-9 at 11:03 ]
38楼2010-06-09 10:09:41
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