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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】请教高手Forcite聚合物退火问题
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pumf

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请教高手Forcite聚合物退火问题 已有3人参与

我建立了聚乙二醇（peg）2000的模型，想对其进行退火，但是不知道怎么设置？另外，聚乙二醇在加工的时候是否需要退火？多谢了。
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1楼 2010-03-26 20:08:03
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l253589424

银虫 (小有名气)

btcl编程

引用回帖:
Originally posted by jiabuda at 2010-03-26 21:17:07:
btcl教程里面好像就有教模拟退火的语句吧，你找找看啊。

我也是新手，希望这个能帮你。


proc annealed_dynamics {temp_start temp_final iterations num_anneals} {
     if {$num_anneals <= 0} re ...

您好，我是新手，对btcl编程不懂，望指教。
自己想编个过程：在amorphous cell中装入两个不同的高聚物，其中一个高聚物的活性分子要是与另一种高聚物的活性分子距离为4埃，则它们可以反应，就用键把他们连起来，不断地循环该过程，是所以高聚物的活性分子都反应成键，以期达到形成一个交联的网络结构。
btcl是可以解决这个问题的，但是具体要怎么编，我就不知道了，请问你有没有该怎么入门？
对于自己编的程序，在AC的minimazation模块中生成的.inp文件中直接追加自己编的程序运行runfile就行了吗？
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5楼2010-06-04 10:52:22
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jiabuda

铁虫 (初入文坛)
★ ★ ★
qasd(金币+3):谢谢 2010-03-26 23:02
pumf(金币+1):多谢，呵呵，我用的是MS，不用编程的。 2010-03-27 08:40
btcl教程里面好像就有教模拟退火的语句吧，你找找看啊。

我也是新手，希望这个能帮你。


proc annealed_dynamics {temp_start temp_final iterations num_anneals} {
     if {$num_anneals <= 0} return
     if {$num_anneals == 1} {
          $T_start = $temp_final
          $T_scale = 0
     } else {
          $T_start = $temp_start
          $T_scale = ($temp_final - $temp_start) / (num_anneals - 1)
     }
     for {$i = 0} {$i < $num_anneals} {incr i} {
          $temp = $T_start + $i * $T_scale
          dynamics iteration = $iterations temperature = $temp
     }
}
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2楼2010-03-26 21:17:07
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qasd

木虫 (著名写手)
★
pumf(金币+1):恩，但是我们没有买AC，所以没法用啊。 2010-03-27 08:40
aylayl08(金币+1):谢谢 2010-04-24 09:27
也可以用AC里面的anneal protocol
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3楼2010-03-26 23:02:51
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jiabuda

铁虫 (初入文坛)
★
pumf(金币+1):多谢了。 2010-04-24 09:02
aylayl08(金币+1):谢谢 2010-04-24 09:27
MS里面可以修改inp文件啊

不就相当于编程了嘛
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4楼2010-04-23 21:06:32
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