24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 808  |  回复: 10
当前主题已经存档。

zhy2219

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】如何知道ITS序列区段

我向genbank提交了序列,但是回信说


Please find your assigned Accession Number(s) in the letter below.

Please provide us with the nucleotide spans of the following:

    - ribosomal RNA
    - internal transcribed spacer

in a tab-delimited feature table:

>Feature gb|GUxxxxxx|
<1    100    rRNA
            product    18S ribosomal RNA
101    200    misc_RNA
            product    internal transcribed spacer 1
201    300    rRNA
            product    5.8S ribosomal RNA
301    400    misc_RNA
            product    internal transcribed spacer 2
401    >500    rRNA
            product    28S ribosomal RNA

If you do not know the exact nucleotide spans, please verify which
of the above components exist in each of your sequences.

Send this information to:  gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov

Thank you and we look forward to hearing from you soon.

Please reply using the original subject line.
This will allow for faster processing of your correspondence.




Sample Text请问,我该怎么做,,,如何知道序列区段是什么呢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhy2219

银虫 (正式写手)

都不懂吗
2楼2010-03-19 18:13:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhy2219

银虫 (正式写手)

自己顶
3楼2010-03-19 18:23:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

long5lizi

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+2): 2010-03-19 21:09
他大概是问你的ITS是哪段?18SrDNA?5.8SrDNA?28SrDNA?5SrDNA?
4楼2010-03-19 20:51:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

long5lizi

新虫 (初入文坛)

他大概是问你的ITS是哪段?18SrDNA?5.8SrDNA?28SrDNA?5SrDNA?
5楼2010-03-19 20:51:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guixiaohua

禁虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
本帖内容被屏蔽

6楼2010-03-19 21:57:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

段家一凡

木虫 (正式写手)

Blast一下就知道了,别人的都已经标出来了18,5.8.28s的位置,你就依葫芦画瓢就可以了。
7楼2010-03-20 00:44:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
值得注意的是,别人的区分结果不一定正确,因为实验是人做出来的,各人使用的实验方法不同,判断的精准度不同,所以已提交的数据可信度不同,但是这些都是很难查得到的。我曾经用自己的一条序列比对,按照得分从高到低的顺序,选用24条比对上的标明了区间的序列与我的序列进行比较,结果出来的结果有好几种,所以就给genbank回信说依照本实验室现有条件和网上搜索得到的数据不能精确界定各个区间。

所以楼主掂量一下自己的方法能不能精确界定,也请认真对待,不然genbank上又多一条会误导他人(在区间界定方面)的序列了。
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
8楼2010-03-20 10:14:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

记错了,刚才打开那个word文档,发现是与16条序列进行比较,不是24条。
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
9楼2010-03-20 10:18:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhy2219

银虫 (正式写手)

非常感谢大家
10楼2010-03-22 15:44:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhy2219 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 307中医考研调剂 +3 于以采蘩 2026-04-14 3/150 2026-04-15 11:16 by xtt..
[考研] 273求调剂 +4 白居不易. 2026-04-09 6/300 2026-04-14 19:54 by 逆水乘风
[考研] 材料299专硕求调剂 +16 +21 2026-04-09 16/800 2026-04-14 17:06 by jiangguiquan11
[考研] 279学硕食品专业求调剂院校 20+6 孤独的狼爱吃羊 2026-04-12 28/1400 2026-04-14 15:44 by zs92450
[考研] 考研求调剂 +6 ban班小七 2026-04-11 6/300 2026-04-14 14:06 by 哆啦A梦只是个梦
[考研] 本科西工大 324求调剂 +5 wysyjs25 2026-04-10 5/250 2026-04-13 23:08 by pies112
[考研] 求调剂,985材料与化工348分 +9 涵竹刘 2026-04-11 14/700 2026-04-13 22:26 by 涵竹刘
[考研] 0854调剂 +10 长弓傲 2026-04-11 11/550 2026-04-13 10:38 by wp06
[教师之家] 山东双非院校考核超级无底线,领导幸灾乐祸,教师遭殃恐 +3 qut2026 2026-04-11 7/350 2026-04-12 20:24 by qut2026
[考研] 0831生医工第一轮调剂失败求助 +12 小熊睿睿_s 2026-04-11 16/800 2026-04-12 16:28 by 钰璞
[考研] 0854调剂 +12 长弓傲 2026-04-09 13/650 2026-04-12 09:56 by 逆水乘风
[考研] 一志愿厦大0856,306求调剂 +15 Bblinging 2026-04-11 15/750 2026-04-11 22:53 by 314126402
[考研] 086003调剂求助 +21 苏弋万 2026-04-09 22/1100 2026-04-11 20:25 by dongdian1
[考研] 283求调剂 086004考英二数二 +17 那个噜子 2026-04-10 18/900 2026-04-11 16:27 by 明月此时有
[考研] 296求调剂 +6 汪!?! 2026-04-09 6/300 2026-04-11 11:25 by zhq0425
[考研] 工科273调剂 +6 X1999 2026-04-09 7/350 2026-04-11 10:23 by zhq0425
[考研] 0854调剂 +4 长弓傲 2026-04-09 4/200 2026-04-11 09:18 by 猪会飞
[考研] 346,工科0854求调剂,专硕 +7 moser233 2026-04-10 8/400 2026-04-11 08:52 by 猪会飞
[考研] 282,电气工程专业,求调剂,不挑专业 +9 jggshjkkm 2026-04-10 9/450 2026-04-10 14:55 by 逆水乘风
[考研] 344求调剂 +7 丶风雪夜归人丶 2026-04-09 7/350 2026-04-10 12:05 by pengliang8036
信息提示
请填处理意见