应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】如何知道ITS序列区段
111/2返回列表12下一页
查看: 780  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

zhy2219

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】如何知道ITS序列区段

我向genbank提交了序列，但是回信说


Please find your assigned Accession Number(s) in the letter below.

Please provide us with the nucleotide spans of the following:

    - ribosomal RNA
    - internal transcribed spacer

in a tab-delimited feature table:

>Feature gb|GUxxxxxx|
<1    100    rRNA
            product    18S ribosomal RNA
101    200    misc_RNA
            product    internal transcribed spacer 1
201    300    rRNA
            product    5.8S ribosomal RNA
301    400    misc_RNA
            product    internal transcribed spacer 2
401    >500    rRNA
            product    28S ribosomal RNA

If you do not know the exact nucleotide spans, please verify which
of the above components exist in each of your sequences.

Send this information to:  gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov

Thank you and we look forward to hearing from you soon.

Please reply using the original subject line.
This will allow for faster processing of your correspondence.




Sample Text请问，我该怎么做，，，如何知道序列区段是什么呢
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2010-03-19 15:19:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhy2219

银虫 (正式写手)
都不懂吗
回复此楼
2楼2010-03-19 18:13:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhy2219

银虫 (正式写手)
自己顶
回复此楼
3楼2010-03-19 18:23:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

long5lizi

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+2): 2010-03-19 21:09
他大概是问你的ITS是哪段？18SrDNA?5.8SrDNA?28SrDNA?5SrDNA?
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-03-19 20:51:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

long5lizi

新虫 (初入文坛)
他大概是问你的ITS是哪段？18SrDNA?5.8SrDNA?28SrDNA?5SrDNA?
赞一下 回复此楼
5楼2010-03-19 20:51:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guixiaohua

禁虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
本帖内容被屏蔽
6楼2010-03-19 21:57:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

段家一凡

木虫 (正式写手)
Blast一下就知道了，别人的都已经标出来了18，5.8.28s的位置，你就依葫芦画瓢就可以了。
赞一下 回复此楼
7楼2010-03-20 00:44:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
值得注意的是，别人的区分结果不一定正确，因为实验是人做出来的，各人使用的实验方法不同，判断的精准度不同，所以已提交的数据可信度不同，但是这些都是很难查得到的。我曾经用自己的一条序列比对，按照得分从高到低的顺序，选用24条比对上的标明了区间的序列与我的序列进行比较，结果出来的结果有好几种，所以就给genbank回信说依照本实验室现有条件和网上搜索得到的数据不能精确界定各个区间。

所以楼主掂量一下自己的方法能不能精确界定，也请认真对待，不然genbank上又多一条会误导他人（在区间界定方面）的序列了。
赞一下(1人) 回复此楼
流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
8楼2010-03-20 10:14:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
记错了，刚才打开那个word文档，发现是与16条序列进行比较，不是24条。
赞一下 回复此楼
流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
9楼2010-03-20 10:18:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhy2219

银虫 (正式写手)
非常感谢大家
回复此楼
10楼2010-03-22 15:44:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhy2219 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600材料与化工306 +4 z1z2z3879 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:44 by ms629
[考研] 333求调剂 +5 87639 2026-03-21 7/350 2026-03-21 19:31 by ColorlessPI
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:39 by 学员8dgXkO
[考研] 299求调剂 +4 某某某某位 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:30 by barlinike
[考研] 330求调剂0854 +3 assdll 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:01 by 搏击518
[考研] 材料学学硕080502 337求调剂-一志愿华中科技大学 +4 顺顺顺mr 2026-03-18 5/250 2026-03-21 10:22 by luoyongfeng
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +5 脱颖而出 2026-03-16 15/750 2026-03-21 10:16 by 脱颖而出
[考研] 306求调剂 +4 chuanzhu川烛 2026-03-18 4/200 2026-03-21 08:25 by laoshidan
[考研] 310求调剂 +3 baibai1314 2026-03-16 3/150 2026-03-21 03:56 by JourneyLucky
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +6 梨花珞晚风 2026-03-17 6/300 2026-03-21 03:40 by JourneyLucky
[考研] 初始318分求调剂（有工作经验） +3 1911236844 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:33 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 Ma_xt 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:05 by JourneyLucky
[考研] 求调剂，一志愿:南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕，总分289分 +4 @taotao 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:14 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 @taotao 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:35 by JourneyLucky
[考研] 261求B区调剂，科研经历丰富 +3 牛奶很忙 2026-03-20 4/200 2026-03-20 19:34 by JourneyLucky
[考研] 288求调剂，一志愿华南理工大学071005 +5 ioodiiij 2026-03-17 5/250 2026-03-19 18:22 by zcl123
[考研] 材料专硕306英一数二 +10 z1z2z3879 2026-03-16 13/650 2026-03-18 14:20 by 007_lilei
[考研] 312求调剂 +8 陌宸希 2026-03-16 9/450 2026-03-18 12:39 by Linda Hu
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林，给自己招师弟中～ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
[考研] 283求调剂 +3 听风就是雨； 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:41 by 热情沙漠
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭