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zhy2219

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】如何知道ITS序列区段

我向genbank提交了序列,但是回信说


Please find your assigned Accession Number(s) in the letter below.

Please provide us with the nucleotide spans of the following:

    - ribosomal RNA
    - internal transcribed spacer

in a tab-delimited feature table:

>Feature gb|GUxxxxxx|
<1    100    rRNA
            product    18S ribosomal RNA
101    200    misc_RNA
            product    internal transcribed spacer 1
201    300    rRNA
            product    5.8S ribosomal RNA
301    400    misc_RNA
            product    internal transcribed spacer 2
401    >500    rRNA
            product    28S ribosomal RNA

If you do not know the exact nucleotide spans, please verify which
of the above components exist in each of your sequences.

Send this information to:  gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov

Thank you and we look forward to hearing from you soon.

Please reply using the original subject line.
This will allow for faster processing of your correspondence.




Sample Text请问,我该怎么做,,,如何知道序列区段是什么呢
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guixiaohua

禁虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
本帖内容被屏蔽

6楼2010-03-19 21:57:41
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long5lizi

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+2): 2010-03-19 21:09
他大概是问你的ITS是哪段?18SrDNA?5.8SrDNA?28SrDNA?5SrDNA?
4楼2010-03-19 20:51:19
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long5lizi

新虫 (初入文坛)

他大概是问你的ITS是哪段?18SrDNA?5.8SrDNA?28SrDNA?5SrDNA?
5楼2010-03-19 20:51:45
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段家一凡

木虫 (正式写手)

Blast一下就知道了,别人的都已经标出来了18,5.8.28s的位置,你就依葫芦画瓢就可以了。
7楼2010-03-20 00:44:46
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