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【求助】求助: DS中的小分子对接可以考虑金属离子的作用吗已有2人参与
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小妹刚刚接触DS，望各位大侠给予指点！ |
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3楼2010-03-15 09:56:14
tjegg
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 6869.3
- 红花: 16
- 帖子: 2615
- 在线: 448小时
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- 性别: GG
- 专业: 抗肿瘤药物药理
2楼2010-03-13 17:20:24
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lei0736(金币+3):谢谢 2010-03-15 11:02
zdm658(金币+1):太好了,谢谢分享 2010-03-15 15:26
lei0736(金币+3):谢谢 2010-03-15 11:02
zdm658(金币+1):太好了,谢谢分享 2010-03-15 15:26
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再插一句，Chen, D.等人专门比较过包含金属离子的分子对接，AutoDock结果较好，但我没有用过AutoDock，楼主可以自己研究一下。 附参考文献： Chen, D., Menche, G., Power, T.D., Sower, L., Peterson, J.W. and Schein, C.H. (2007) "Accounting for ligand-bound metal ions in docking small molecules on adenylyl cyclase toxins." Proteins, 2007. 67(3): 593-605. 作者比较了AutoDock 3.05., LigandFit/Cerius2 4.10 and FlexX (in SYBYL 7.0) |
4楼2010-03-15 10:10:08
5楼2010-05-30 10:13:54