24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 767  |  回复: 6
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

jghe

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】如何用eigenvector-following methods 搜索过渡态?

如题,不管用什么软件,介绍一下这种方法的原理也行,谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jghe

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by sobereva at 2010-01-28 19:33:56:
本征向量跟踪(EF)就是不断地沿着Hessian矩阵本征值最小的本征向量方向移动(也可以自行指定跟踪哪个本征向量),使此方向能量不断升高,直到找到过渡态。每走一步重新算本征向量确定下一步移动方向。
在实际使用 ...

谢谢回复,我还有一个疑问,所选的本征向量是不是一定要实频?可以选虚频吗?我现在用的是Dmol3,有用这个做的吗?
4楼2010-01-29 09:58:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★
jghe(金币+3):thanks 2010-01-29 09:55
yjcmwgk(金币+3):sobereva大侠果然身手不凡 2010-01-29 12:39
本征向量跟踪(EF)就是不断地沿着Hessian矩阵本征值最小的本征向量方向移动(也可以自行指定跟踪哪个本征向量),使此方向能量不断升高,直到找到过渡态。每走一步重新算本征向量确定下一步移动方向。
在实际使用中会添加一些额外的设定使方法更可靠,比如高斯的opt=(EF,TS),每一步也同时在其它本征向量方向上向降低能量方向移动。实际上高斯的berny方法本质上已经包含了EF方法,而且比EF更为可靠。
2楼2010-01-28 19:33:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

recoli

金虫 (正式写手)

高人出现,顶一下
3楼2010-01-29 01:51:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★
yjcmwgk(金币+3): 2010-01-30 08:52
jghe(金币+2):很详细,太感谢了 2010-02-03 21:56
引用回帖:
Originally posted by jghe at 2010-01-29 09:58:25:

谢谢回复,我还有一个疑问,所选的本征向量是不是一定要实频?可以选虚频吗?我现在用的是Dmol3,有用这个做的吗?

跟踪哪个本征向量是随意的,一般跟踪本征值最低的。
本征值最低,在平衡态区域内就是最小的正值,在过渡态区域附近就是最负的负值,对应于虚频。所以跟踪实频或虚频不是必然的,如果初始位置就在过渡态附近,就要跟踪虚频,否则跟踪实频会离过渡态越来越远。如果在平衡态附近,就没有虚频了,只能跟踪实频。

若不确定,跟踪本征值最低即可,若初始位置是平衡态附近,到达过渡态过程中在经历势能面拐点的时候会自动由实变虚,如果已在过渡态附近,这个虚频模式会一直保持到过渡态,最后成为过渡态唯一虚频。
5楼2010-01-29 22:40:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 申博自荐 +3 Linxia林夏 2026-04-13 3/150 2026-04-16 12:55 by 墨荷之露
[考研] 327求调剂 +26 Xxjc1107. 2026-04-13 29/1450 2026-04-16 10:52 by Espannnnnol
[考研] 22408 312求调剂 +21 门路摸摸 2026-04-14 22/1100 2026-04-16 10:51 by 阿文超
[考研] 一志愿华中农业071010,320求调剂 +12 困困困困坤坤 2026-04-14 14/700 2026-04-16 10:18 by beilsong20
[考研] 279学硕食品专业求调剂院校 20+7 孤独的狼爱吃羊 2026-04-12 29/1450 2026-04-16 09:00 by screening
[考研] 求调剂学校 +14 不会吃肉 2026-04-13 16/800 2026-04-15 21:59 by noqvsozv
[考研] 071000生物学调剂求助 +18 zzzzwww 2026-04-09 21/1050 2026-04-14 15:39 by zs92450
[考研] 人工智能320调剂08工类还有机会吗 +18 振—TZ 2026-04-10 19/950 2026-04-14 10:34 by screening
[考研] 085600材料与化工349分求调剂 +16 李木子啊哈哈 2026-04-12 17/850 2026-04-14 09:11 by fenglj492
[基金申请] 2026 WR青拔 +3 冬日阳光CAS 2026-04-09 6/300 2026-04-13 18:40 by liuchb715
[考研] 297工科,求调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-12 13/650 2026-04-13 14:12 by dingyanbo1
[考研] 材料考研调剂 +29 云木达达 2026-04-11 31/1550 2026-04-13 13:32 by lyh鲁老师
[考研] 生物学调剂 +11 小冉要努力 2026-04-10 13/650 2026-04-13 11:46 by 电化学及催化
[考研] 22408 352分求调剂 +5 努力的夏末 2026-04-09 5/250 2026-04-12 19:17 by wj165256
[考研] 2本,初试303,0860求调剂 +6 floriea 2026-04-12 8/400 2026-04-12 18:13 by zhouxiaoyu
[考研] 广东省 085601 329分求调剂 +14 Eddieddd 2026-04-10 14/700 2026-04-11 09:58 by bljnqdcc
[考研] 中药学调剂 初试324 +4 洋甘菊、 2026-04-10 6/300 2026-04-11 09:41 by gong120082
[考研] 0854调剂 +4 长弓傲 2026-04-09 4/200 2026-04-11 09:18 by 猪会飞
[考研] 已调剂 +18 柴郡猫_ 2026-04-09 19/950 2026-04-09 22:10 by 柴郡猫_
[考研] 337求调剂 +4 Gky09300550, 2026-04-09 4/200 2026-04-09 17:18 by 帕尔马拉特
信息提示
请填处理意见