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jghe

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】如何用eigenvector-following methods 搜索过渡态?

如题,不管用什么软件,介绍一下这种方法的原理也行,谢谢!
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recoli

金虫 (正式写手)

高人出现,顶一下
3楼2010-01-29 01:51:12
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★
jghe(金币+3):thanks 2010-01-29 09:55
yjcmwgk(金币+3):sobereva大侠果然身手不凡 2010-01-29 12:39
本征向量跟踪(EF)就是不断地沿着Hessian矩阵本征值最小的本征向量方向移动(也可以自行指定跟踪哪个本征向量),使此方向能量不断升高,直到找到过渡态。每走一步重新算本征向量确定下一步移动方向。
在实际使用中会添加一些额外的设定使方法更可靠,比如高斯的opt=(EF,TS),每一步也同时在其它本征向量方向上向降低能量方向移动。实际上高斯的berny方法本质上已经包含了EF方法,而且比EF更为可靠。
2楼2010-01-28 19:33:56
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jghe

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by sobereva at 2010-01-28 19:33:56:
本征向量跟踪(EF)就是不断地沿着Hessian矩阵本征值最小的本征向量方向移动(也可以自行指定跟踪哪个本征向量),使此方向能量不断升高,直到找到过渡态。每走一步重新算本征向量确定下一步移动方向。
在实际使用 ...

谢谢回复,我还有一个疑问,所选的本征向量是不是一定要实频?可以选虚频吗?我现在用的是Dmol3,有用这个做的吗?
4楼2010-01-29 09:58:25
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★
yjcmwgk(金币+3): 2010-01-30 08:52
jghe(金币+2):很详细,太感谢了 2010-02-03 21:56
引用回帖:
Originally posted by jghe at 2010-01-29 09:58:25:

谢谢回复,我还有一个疑问,所选的本征向量是不是一定要实频?可以选虚频吗?我现在用的是Dmol3,有用这个做的吗?

跟踪哪个本征向量是随意的,一般跟踪本征值最低的。
本征值最低,在平衡态区域内就是最小的正值,在过渡态区域附近就是最负的负值,对应于虚频。所以跟踪实频或虚频不是必然的,如果初始位置就在过渡态附近,就要跟踪虚频,否则跟踪实频会离过渡态越来越远。如果在平衡态附近,就没有虚频了,只能跟踪实频。

若不确定,跟踪本征值最低即可,若初始位置是平衡态附近,到达过渡态过程中在经历势能面拐点的时候会自动由实变虚,如果已在过渡态附近,这个虚频模式会一直保持到过渡态,最后成为过渡态唯一虚频。
5楼2010-01-29 22:40:10
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