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greatsaint

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】如何做菌落PCR?

最近想做菌落PCR,但是不知道具体如何操作,特别是需要注意什么问题,请大家帮忙。谢谢!
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen


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我的步骤:
1:挑取单克隆入小离心管,进行裂解(15Min);
2:往离心管加入PCR的物质(buffer 酶,DMSO,引物等),然后分装(看你做多少体系了);
3:待模板裂解完毕,加入模板,然后进行PCR!
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
8楼2010-01-27 13:49:23
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IDname

捐助贵宾 (正式写手)

钢虫


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
就是用菌落代替模板,把单菌落挑出来放进PCR体系,开始P
挑单菌落可以用PCR clean的tips,注意尽量别挑培养基
2楼2010-01-27 11:43:46
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挥汗如雨

至尊木虫 (职业作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我们操作方法如下:
1. 在1.5 ml的离心管中加入0.5 ml 液体培养基;
2. 用牙签或小枪头挑取平板上的菌落单斑;
3: 带有菌的牙签放入离心管,然后取出,盖好盖子过夜摇菌培养;
4: 20微升PCR体系,加入摇好的菌液1微升,35个循环;
5: 剩余菌液保存菌种。
人生有三样东西不可挽回:时间,机遇,还有说出去的话。
3楼2010-01-27 12:40:34
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hongrunge

铁杆木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
楼上的感觉和菌液PCR没什么区别。
直接用灭过菌的牙签挑取少量菌体至tube中,加入配好的体系即可。
挑取的菌体不要太多,tube管底可见淡淡的菌体痕迹即可;挑入菌体量过多反而容易干扰试验,造成非特异性扩增等不良后果
4楼2010-01-27 12:56:31
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gyesang

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引用回帖:
Originally posted by 挥汗如雨 at 2010-01-27 12:40:34:
我们操作方法如下:
1. 在1.5 ml的离心管中加入0.5 ml 液体培养基;
2. 用牙签或小枪头挑取平板上的菌落单斑;
3: 带有菌的牙签放入离心管,然后取出,盖好盖子过夜摇菌培养;
4: 20微升PCR体系,加入摇好的菌 ...

这样做还是略显麻烦
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2010-01-27 13:07:08
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

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引用回帖:
Originally posted by hongrunge at 2010-01-27 12:56:31:
楼上的感觉和菌液PCR没什么区别。
直接用灭过菌的牙签挑取少量菌体至tube中,加入配好的体系即可。
挑取的菌体不要太多,tube管底可见淡淡的菌体痕迹即可;挑入菌体量过多反而容易干扰试验,造成非特异性扩增等 ...

菌体过多会扩不出来带来,反而全滞留在胶孔里面,电泳的时候
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
6楼2010-01-27 13:08:03
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gyesang

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我通常会这样做:
第一种方法:
在PCR管子里面先加上10ul的水,然后编上号1,2,3,4,5,6,7.。。。。。。同时在一块新的LB固体平板上,画上格子也编上号1,2,3,4,5,6,7.。。。。。。。。,然后开始挑菌,第一个,先在平板上的标1号处,划上二到三下,然后再在标1号的PCR管吹洗几下,以此类推,然后平板放培养箱培养,稀释有菌体的水做模板,正常做PCR,跑完后电泳,确定结果,在平板上把阳性克隆用笔画出
第二种方法:
上面的稀释有菌体的水取一部分做PCR,剩余的部分4度或者冰上保存,等PCR结束电泳后,直接挑阳性克隆的水放到液体LB培养基培养就可以了,这步就不用画板子了,但这种方法有缺陷,就是没有划到新板子上以后菌取用起来方便
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
7楼2010-01-27 13:16:21
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yujiaping1

木虫 (著名写手)


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挑菌落放到10ul水中,混匀后,取1ulPCR,这样可以保证浓度不会太大,也不会有培养基的干扰
9楼2010-01-27 13:58:00
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qqsvery

木虫 (著名写手)

菌落PCR(Colony PCR)可不必提取基因组DNA,不必酶切鉴定,而是直接以菌体热解后暴露的DNA为模板进行PCR扩增,省时少力。建议使用载体上的通用引物。通常利用此方法进行重组体的筛选或者DNA测序分析。最后的PCR产物大小是载体通用引物之间的插入片断大小。

详细方法给你个网站,仔细看看吧:

菌落PCR(Colony PCR)方法
http://www.bbioo.com/bio101/2007/19750.htm
谎言和真实在河边洗澡,谎言先洗好,穿走了真实的衣服,真实却不肯穿谎言的衣服。后来人们眼里只有穿着真实衣服的谎言,却很难接受赤裸裸的真实。
10楼2010-01-27 14:19:21
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