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【求助】DL_POLY的config文件如何生成?? 已有9人参与
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我想模拟聚合物在金属团簇表面的吸附,想请教大家这样的体系的config文件如何生成? 另外我把手册已经看了一遍,但是希望运行一下.有么有人根据手册的算例给写一个模拟过程,给传一个谢谢!! |
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在 dl_poly手册中关于Potential Of mean Force Constraints,有这样的描述 If a number of simulations are conducted with the system constrained to different points along the reaction coordinate then the mean constraint force may be plotted as a function of reaction coordinate and the function integrated to obtain the free energy for the overall process. DL POLY 3 reports the PMF constraint virial, WPMF , for each simulation. Users can convert this to the PMF constraint force from GPMF = -WPMF/dPMF where is dPMF the constraint distance between the two groups used to define the reaction coordinate. 我想问这里计算了the PMF constraint force , 然后可以通过对2个粒子之间的相互限制力与粒子之间的距离积分得到pmf呢?? |
90楼2010-05-05 17:00:22