版块导航: 正在加载中...

客户端APP下载

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

【奖励】本帖被评价15次，作者neweroica增加金币 12.65 个

neweroica

木虫 (著名写手)

应助: 53 (初中生)
金币: 4992.5
帖子: 2470
在线: 216.6小时
虫号: 36775

[资源] 【原创】用GaussView可视化VASP的结构优化过程

在此我就奉献一下我写的GaussView对VASP的接口程序——vout2gout脚本，用它你就可以用GaussView查看VASP的结构优化过程和结果。

功能：

1. 将OUTCAR文件转成GaussView可识别的*.out文件。

2. 显示晶胞。

3. 可视化几何构型的优化过程。

4. 查看优化过程中体系总能量和力（RMS平均）的变化曲线。

5. 可视化各个步骤中的各原子的受力情况以及预测下一步各原子的位移。

6. 导出优化过程的动画。

详细介绍和下载，见
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1792168&pid=18071456

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

第一性原理计算资源总汇	材料计算模拟实用技巧	第一性原理相关文档	VASP使用技巧
第一性原理计算经验

» 猜你喜欢

孩子确诊有中度注意力缺陷已经有14人回复
三甲基碘化亚砜的氧化反应已经有4人回复
请问下大家为什么这个铃木偶联几乎不反应呢已经有5人回复
请问有评职称，把科研教学业绩算分排序的高校吗已经有5人回复
2025冷门绝学什么时候出结果已经有3人回复
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入已经有4人回复
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生已经有6人回复
AI论文写作工具：是科研加速器还是学术作弊器？已经有3人回复
论文投稿，期刊推荐已经有4人回复
请问2026国家基金面上项目会启动申2停1吗已经有5人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

vasp 结构优化问题已经有14人回复
求助：vasp结构优化不能收敛已经有18人回复
VASP结构优化出错已经有9人回复
VASP优化结构遇到的问题。已经有9人回复
【活动or资源】vasp晶体结构优化已经有142人回复
【求助】vasp 高压相结构优化已经有17人回复
【求助】请问如何看vasp结构优化的过程，就像castep里面的轨迹一样。已经有7人回复
【求助】VASP怎么做晶格参数的结构优化已经有17人回复
【求助完毕】VASP结构优化时离子步原子是如何移动的？已经有6人回复
【求助】VASP结构优化已经有7人回复
【求助成功】VASP中，如何固定磁矩做结构优化已经有14人回复
【neweroica个人文集】最新版vaspmo (v0.1) ――可视化VASP分子轨道已经有103人回复
【neweroica个人文集】GaussView对VASP的接口程序—— vout2gout (v0.0) 已经有129人回复

1楼2010-01-13 09:08:05

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

xirainbow

木虫 (正式写手)

这个牛；）

2楼2010-01-13 12:25:43

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

jghe

金虫 (著名写手)

很好很强大

3楼2010-01-13 19:10:20

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

yuxiao_zihan

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 102.4
帖子: 24
在线: 20分钟
虫号: 403661

★★★ 三星级,支持鼓励

支持原创

6楼2010-01-13 22:10:05

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)

应助: 7 (幼儿园)
金币: 7994.9
帖子: 776
在线: 569小时
虫号: 773188

★★★★★ 五星级,优秀推荐

支持～～～～～～～···

7楼2010-01-13 23:48:33

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

ydeng2639

木虫 (小有名气)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 1687.6
帖子: 203
在线: 241.5小时
虫号: 721776

★★★ 三星级,支持鼓励

厉害！

8楼2010-01-15 09:54:01

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

wangyujia

木虫 (正式写手)

应助: 6 (幼儿园)
金币: 1704.3
帖子: 369
在线: 79.7小时
虫号: 459079

★★★★★ 五星级,优秀推荐

牛啊！
有一个小问题，我导出来的模型中的所有原子怎么都是Gauss ghost atoms啊？？

10楼2010-01-15 16:47:43

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

neweroica

木虫 (著名写手)

应助: 53 (初中生)
金币: 4992.5
帖子: 2470
在线: 216.6小时
虫号: 36775

引用回帖:

Originally posted by wangyujia at 2010-1-15 16:47:
牛啊！
有一个小问题，我导出来的模型中的所有原子怎么都是Gauss ghost atoms啊？？

Could you send your OUTCAR to my email so that I can check it?

11楼2010-01-15 18:02:25

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

wangyujia

木虫 (正式写手)

应助: 6 (幼儿园)
金币: 1704.3
帖子: 369
在线: 79.7小时
虫号: 459079

引用回帖:

Originally posted by neweroica at 2010-1-15 18:02:

Could you send your OUTCAR to my email so that I can check it?

好啊！你的email是？？

12楼2010-01-15 19:13:36

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

neweroica

木虫 (著名写手)

应助: 53 (初中生)
金币: 4992.5
帖子: 2470
在线: 216.6小时
虫号: 36775

引用回帖:

Originally posted by wangyujia at 2010-1-15 19:13:

好啊！你的email是？？

代码里有

13楼2010-01-15 19:16:41

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

漂泊四方

金虫 (小有名气)

1ST强帖: 2
应助: 4 (幼儿园)
金币: 1321.2
帖子: 198
在线: 115.2小时
虫号: 897145

引用回帖:

Originally posted by neweroica at 2010-01-13 09:08:05:
在此我就奉献一下我写的GaussView对VASP的接口程序——vout2gout脚本，用它你就可以用GaussView查看VASP的结构优化过程和结果。

功能：

1. 将OUTCAR文件转成GaussView可识别的*.out文件。

2. 显示晶胞。 ...

感谢楼主，很好很强大。

15楼2010-03-14 23:46:38

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

nyoxd

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 64.6
帖子: 112
在线: 99.5小时
虫号: 466065

★★★★★ 五星级,优秀推荐

强顶，向原创致敬·····

16楼2010-03-30 10:19:37

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

rainywrn

金虫 (正式写手)

应助: 5 (幼儿园)
金币: 1398.1
帖子: 780
在线: 182.3小时
虫号: 852396

顶好，加油

17楼2010-04-25 15:43:29

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

awmc2008

至尊木虫 (文坛精英)

应助: 62 (初中生)
金币: 15826.6
帖子: 12135
在线: 732.4小时
虫号: 600677

★★★★★ 五星级,优秀推荐

学习学习，谢谢楼主。

18楼2010-04-25 20:59:26

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

fulin

木虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1713.1
帖子: 154
在线: 98.8小时
虫号: 832930

★ 一星级,一般

我也想试试

19楼2010-05-01 11:00:58

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

vasp001

金虫 (正式写手)

应助: 69 (初中生)
金币: 1513.7
帖子: 702
在线: 326小时
虫号: 727265

用VAMD 直接读XDATCAR 也可以看优化的过程。

20楼2010-05-13 10:12:28

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

jyzhao1981

木虫 (正式写手)

应助: 19 (小学生)
金币: 3345.5
帖子: 558
在线: 90.7小时
虫号: 152951

★★★★★ 五星级,优秀推荐

向楼主致敬

21楼2010-05-16 10:34:15

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

1ST强帖: 13
应助: 241 (大学生)
金币: 25701.7
帖子: 3782
在线: 873.8小时
虫号: 1007127

另外一个方法就是：在结构优化时，每一步的原子位置也写到了 XDATCAR文件中，从http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/
下载一个工具xdat2xyz.pl，它将XDATCAR转换为.xyz的文件。
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/src/xdat2xyz.pl

得到.xyz文件就可以用molden或jmol之类的软件来看每一步优化原子的动画了。

22楼2010-05-16 14:19:17

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

哥是传说

铁杆木虫 (正式写手)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 6409.2
帖子: 541
在线: 755.8小时
虫号: 1028025

好，不过听说medea也是可视化的vasp谁有它的教程

23楼2010-06-01 09:00:15

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

leihongwen

木虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 3075.5
帖子: 116
在线: 209.6小时
虫号: 960122

★★★★★ 五星级,优秀推荐

顶一下好帖子

24楼2010-11-03 11:22:31

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《第一性原理计算资源总汇》

25楼2011-08-30 16:14:21

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

thinkllh

铁杆木虫 (正式写手)

应助: 34 (小学生)
金币: 6569.1
帖子: 538
在线: 157小时
虫号: 715800

★★★ 三星级,支持鼓励

收下了，谢谢。

26楼2011-09-20 22:10:34

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

简单回复

2010-01-13 19:42 回复

2010-01-13 21:38 回复

wonderflyer9楼

2010-01-15 10:18 回复

2010-01-15 21:35 回复

2012-01-29 18:39 回复

五星好评牛。。。。。。。。。

相关版块跳转我要订阅楼主 neweroica 的主题更新