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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【原创】用GaussView可视化VASP的结构优化过程
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neweroica

木虫 (著名写手)

[资源] 【原创】用GaussView可视化VASP的结构优化过程

在此我就奉献一下我写的GaussView对VASP的接口程序——vout2gout脚本，用它你就可以用GaussView查看VASP的结构优化过程和结果。

功能：

1. 将OUTCAR文件转成GaussView可识别的*.out文件。

2. 显示晶胞。

3. 可视化几何构型的优化过程。

4. 查看优化过程中体系总能量和力（RMS平均）的变化曲线。

5. 可视化各个步骤中的各原子的受力情况以及预测下一步各原子的位移。

6. 导出优化过程的动画。


详细介绍和下载，见
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1792168&pid=18071456
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1楼 2010-01-13 09:08:05
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xirainbow

木虫 (正式写手)
这个牛；）
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2楼2010-01-13 12:25:43
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jghe

金虫 (著名写手)
很好很强大
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3楼2010-01-13 19:10:20
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yuxiao_zihan

新虫 (初入文坛)

★★★ 三星级,支持鼓励

支持原创
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6楼2010-01-13 22:10:05
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

支持～～～～～～～···
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7楼2010-01-13 23:48:33
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ydeng2639

木虫 (小有名气)

★★★ 三星级,支持鼓励

厉害！
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8楼2010-01-15 09:54:01
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wangyujia

木虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

牛啊！
有一个小问题，我导出来的模型中的所有原子怎么都是Gauss ghost atoms啊？？
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10楼2010-01-15 16:47:43
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neweroica

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by wangyujia at 2010-1-15 16:47:
牛啊！
有一个小问题，我导出来的模型中的所有原子怎么都是Gauss ghost atoms啊？？

Could you send your OUTCAR to my email so that I can check it?
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11楼2010-01-15 18:02:25
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wangyujia

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by neweroica at 2010-1-15 18:02:


Could you send your OUTCAR to my email so that I can check it?

好啊！你的email是？？
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12楼2010-01-15 19:13:36
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neweroica

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by wangyujia at 2010-1-15 19:13:



好啊！你的email是？？

代码里有
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13楼2010-01-15 19:16:41
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漂泊四方

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by neweroica at 2010-01-13 09:08:05:
在此我就奉献一下我写的GaussView对VASP的接口程序——vout2gout脚本，用它你就可以用GaussView查看VASP的结构优化过程和结果。

功能：

1. 将OUTCAR文件转成GaussView可识别的*.out文件。

2. 显示晶胞。 ...

感谢楼主，很好很强大。
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15楼2010-03-14 23:46:38
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nyoxd

银虫 (小有名气)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

强顶，向原创致敬·····
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16楼2010-03-30 10:19:37
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rainywrn

金虫 (正式写手)
顶好，加油
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17楼2010-04-25 15:43:29
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awmc2008

至尊木虫 (文坛精英)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

学习学习，谢谢楼主。
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18楼2010-04-25 20:59:26
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fulin

木虫 (小有名气)

★ 一星级,一般

我也想试试
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19楼2010-05-01 11:00:58
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vasp001

金虫 (正式写手)
用VAMD 直接读XDATCAR 也可以看优化的过程。
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20楼2010-05-13 10:12:28
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jyzhao1981

木虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

向楼主致敬
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21楼2010-05-16 10:34:15
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
另外一个方法就是：在结构优化时，每一步的原子位置也写到了 XDATCAR文件中，从http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/
下载一个工具xdat2xyz.pl，它将XDATCAR转换为.xyz的文件。
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/src/xdat2xyz.pl

得到.xyz文件就可以用molden或jmol之类的软件来看每一步优化原子的动画了。
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22楼2010-05-16 14:19:17
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哥是传说

铁杆木虫 (正式写手)
好，不过听说medea也是可视化的vasp谁有它的教程
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23楼2010-06-01 09:00:15
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leihongwen

木虫 (小有名气)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

顶一下好帖子
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24楼2010-11-03 11:22:31
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《第一性原理计算资源总汇》
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25楼2011-08-30 16:14:21
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thinkllh

铁杆木虫 (正式写手)

★★★ 三星级,支持鼓励

收下了，谢谢。
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26楼2011-09-20 22:10:34
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简单回复
wuchenwf4楼
2010-01-13 19:42   回复  
 
lwg0208105楼
2010-01-13 21:38   回复  
 
wonderflyer9楼
2010-01-15 10:18   回复  
 
zdhlover14楼
2010-01-15 21:35   回复  
 
独唱团27楼
2012-01-29 18:39   回复  
五星好评  牛。。。。。。。。。
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