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neweroica

木虫 (著名写手)


[资源] 【原创】用GaussView可视化VASP的结构优化过程

在此我就奉献一下我写的GaussView对VASP的接口程序——vout2gout脚本,用它你就可以用GaussView查看VASP的结构优化过程和结果。

功能:

1. 将OUTCAR文件转成GaussView可识别的*.out文件。

2. 显示晶胞。

3. 可视化几何构型的优化过程。

4. 查看优化过程中体系总能量和力(RMS平均)的变化曲线。

5. 可视化各个步骤中的各原子的受力情况以及预测下一步各原子的位移。

6. 导出优化过程的动画。


详细介绍和下载,见
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1792168&pid=18071456
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另外一个方法就是:在结构优化时,每一步的原子位置也写到了 XDATCAR文件中,从http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/
下载一个工具xdat2xyz.pl,它将XDATCAR转换为.xyz的文件。
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/src/xdat2xyz.pl

得到.xyz文件就可以用molden或jmol之类的软件来看每一步优化原子的动画了。
22楼2010-05-16 14:19:17
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查看全部 27 个回答

fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

支持~~~~~~~···
7楼2010-01-13 23:48:33
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wangyujia

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

牛啊!
有一个小问题,我导出来的模型中的所有原子怎么都是Gauss ghost atoms啊??
10楼2010-01-15 16:47:43
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neweroica

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by wangyujia at 2010-1-15 16:47:
牛啊!
有一个小问题,我导出来的模型中的所有原子怎么都是Gauss ghost atoms啊??

Could you send your OUTCAR to my email so that I can check it?
11楼2010-01-15 18:02:25
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