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【求助】请问可不可以做含水的分子对接
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一般做对接时候都要把水去掉，现在有一个体系，存在配体-水-蛋白质的作用，请问能不能把活性口袋里面的水保留下来，做对接，这样合理吗？ 另外：我用ADT加氢的时候，发现系统不给水分子加氢，请问是这样的吗，只能通过别的软件加氢了吗？ |
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