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coolrainbow

木虫 (著名写手)

未来国家冻凉

[交流] 【求助】请问可不可以做含水的分子对接

一般做对接时候都要把水去掉,现在有一个体系,存在配体-水-蛋白质的作用,请问能不能把活性口袋里面的水保留下来,做对接,这样合理吗?

另外:我用ADT加氢的时候,发现系统不给水分子加氢,请问是这样的吗,只能通过别的软件加氢了吗?
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fantastic

银虫 (著名写手)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 1-7 14:16
引用回帖:
Originally posted by coolrainbow at 2010-1-7 08:31:


为什么呢?是不是水的类型在autodock参数里里没有对应的类型呢?

我也不知道!但是我们做对接的时候,一般都是会把水分子删除的!
4楼2010-01-07 10:05:52
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