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yoyoyehan

[交流] 怎么判断双酶切是否切开?

原核载体pET28,内切酶是XbaI和XhoI,宝生物的,我的体系是
    XbaI   1
    XhoI   1
10  Buffer    2
载体     16(浓度较低,用的较多)        反应  37度   4小时,
请问:怎么判断我的载体是否切开了?除了跑胶之外,各位虫友有什么好的方法  判断么?
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zhaocy8903

木虫 (知名作家)


1949stone(金币+1,VIP+0): 12-2 11:38
连接,转化
2楼2009-12-02 08:37:16
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liyong1981

金虫 (正式写手)


★ ★ ★
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1949stone(金币+2,VIP+0): 12-2 11:38
高浓度的琼脂糖胶,和原始质粒对比跑电泳,看仔细可以看得出来的,
3楼2009-12-02 09:07:09
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漫迹

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
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1949stone(金币+2,VIP+0): 12-2 11:38
PCR看能P出目的片段来,有的话应该是连上了,PCR产物也可以进行T连接,双酶切进一步验证
4楼2009-12-02 09:48:19
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lzhwin

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
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amisking(金币+3,VIP+0): 12-2 12:34
跑电泳是最简单的方法啊,楼主酶切的目的是什么?验证还是要胶回收连接目的片段呢?
把样品全点进去,然后点marker,如果切开的话因为是线性DNA应该能显示PET28的正确大小。如果酶切不完全会看到两条带(没切开的质粒和切开的质粒)。


如果是做胶回收楼主的体系太小,会导致酶切不完全或者量不够回收。不知道楼主是用什么方法提的质粒,浓度再小加16微升也太多了。
我们一般验证用10微升体系,质粒一般加2-4微升,酶切回收的话一般用40-80微升体系。酶的用量要尽量按照说明书等比例扩大或者缩小。

[ Last edited by lzhwin on 2009-12-2 at 12:10 ]
5楼2009-12-02 12:08:54
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695

木虫 (职业作家)


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引用回帖:
Originally posted by liyong1981 at 2009-12-2 09:07:
高浓度的琼脂糖胶,和原始质粒对比跑电泳,看仔细可以看得出来的,

我也是这么做的,有时候可以再加上分别的单酶切,更保险点
6楼2009-12-02 16:38:46
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
线性的质粒比环形的质粒跑的慢的,如果切开了的话会跑的比原始质粒慢的。
7楼2009-12-02 18:23:51
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