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xppcomeon

捐助贵宾 (正式写手)

[交流] 【求助】如何将PDB文件蛋白与配基复合物中的配基去除获得自由受体蛋白

我从数据库中下载了蛋白的PDB文件,但这些文件都是受体蛋白与小分子配基复合物的形式,而且小分子配基不同,一个受体蛋白搜到的这种蛋白与小分子配基复合物PDB文件有许多,我想做一受体蛋白与我的化合物库的docking工作,想问我该怎样选择PDB文件?还有蛋白与小分子配基复合物PDB文件我怎样将配基去除得到自由受体蛋白呢?谢谢各位tx,急用
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javacfish

金虫 (小有名气)

★ ★
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zeoliters(金币+1,VIP+0):多谢回帖交流! 12-8 15:08
ainimoAcid是选择氨基酸,配体应该不是氨基酸吧, 是的话,在选择其他

你删除之后一定要"另存为".
10楼2009-12-01 21:35:16
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javacfish

金虫 (小有名气)


zeoliters(金币+1,VIP+0):多谢回帖交流! 12-8 15:08
sybyl,很简单的实现
2楼2009-12-01 19:50:25
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xppcomeon

捐助贵宾 (正式写手)

我现在在网上下了破解版的Discovery studio 2.1,用这个软件该怎么做呢?
3楼2009-12-01 19:53:09
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javacfish

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
load protein
DS也可以,edit---select,然后你自己在看看
4楼2009-12-01 20:02:52
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