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【求助】如何计算有机小分子的三重态能级(T1-S0)?
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看了论坛里很多大牛关于类似问题的回复,但是还是不知道在Gaussian中如何具体操作。拿最简单的吡啶环为例来说吧: 1.先优化基态的最低能量构型: # opt b3lyp/6-31+g(d) Charge = 0 Multiplicity = 1 2.接着计算三重态的所谓垂直激发能: # td=(triplets,nstates=3,root=1) b3lyp/6-31+g(d) Charge = 0 Multiplicity = 1 3.然后优化此三重态的最低能量构型: # opt b3lyp/6-31+g(d) Charge = 0 Multiplicity = 3 问题是第二步计算了三个三重态,此步优化的是不是这三个三重态呢?还是应该在第二步中只计算一个三重态,然后在此步中优化此三重态也就是我们需要的T1态呢?还有这一步中自旋多重度为3没有错误吧?引申一下,若是在第二步中计算了十个单重态(也即十个吸收峰,假设它们均存在),在此步中优化单重态的最低能量构型如何计算,自旋多重度也是3对吗? 4.最关键一步,就是计算从最低能量构型的三重态回落到基态的过程,不知道如何计算? 我知道对各位大牛来说,这是个最简单计算发射光谱(不论是荧光光谱还是磷光光谱)的事情,原理也就是F-C原理搞清楚了,计算应该没有问题,可是对我们菜鸟来说,这些具体的操作才是问题的关键,希望各位大牛能够耐心指点一下,而不是一句F-C原理了事,谢谢大家了! 另外相关问题是:在计算类似问题时,我们这些非专业的人也就是用普通带XP的计算机算算而已,分子中要是有3到7个环左右(而这在有机合成中是非常常见的)时,可能光优化构型就得好几天,这中途要是碰上什么事情(停电、误操作等)停机了,就只能从头开始算,有没有什么办法能够接着上次终止的地方继续计算的,如何操作?我知道对各位专业人士来说这种事情无法想象,可国情如此,只好这么不专业地蛮干了。 |
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wuy069
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xtdut(金币+5,VIP+0):非常感谢您的回复! 11-6 13:11
xtdut(金币+5,VIP+0):非常感谢您的回复! 11-6 13:11
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首先你的3个步骤都是正确的。 第二步计算td,gaussian默认三个态,如果是对称性高的分子建议用 Largest Abelian subgroup 后的Nop 个数。为什么计算一个态需要用3个态或更多的态呢,那是因为求解这个态,需要用其它的态来对它就解。第2步,自旋多重度还是写1,因为垂直激发是基于基态的构型,所以电荷和自旋多重度都是基态的。 第3步,优化激发态的构型,电荷和自旋多重度当然需要激发态的,所以电荷和自旋多重度为0 3. 要想计算有机小分子的三重态能级(T1-S0),即是算激发态的发射,但是gaussian中没这么直接的,我们可以转换一下思路:要算发射,基于F-C原理,这时用优化好的激发态的构型,但是电荷和自旋多重度写0 1,那这时的构型相当于垂直时的基态构型,这时再做td,从输出文件中找到Excited State 1: Triplet-A 2.6936 eV 460.28 nm f=0.0000 |
3楼2009-11-06 12:06:19
wuy069
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xtdut(金币+5,VIP+0):非常感谢!另外关于停机后接着继续计算,你有没有什么好的办法? 11-6 14:21
xtdut(金币+5,VIP+0):非常感谢!另外关于停机后接着继续计算,你有没有什么好的办法? 11-6 14:21
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用下面这一种 #p td=(triplets,nstates=15,root=1,direct) b3lyp/6-31+g(d) test 0 1 因为是算三重态,所以命令行写triplets;而用的是基态的构型,所以电荷和自旋多重度写0 1 你第3步优化的是第一个三重态(即T1态),后面说的对的,但要算第二或三激发态的td,你应该优化好了激发态再做td. 如果你研究的分子比较大,建议把nstates写大一些,要不可能会出错 [ Last edited by wuy069 on 2009-11-6 at 14:12 ] |
5楼2009-11-06 14:08:01
wuy069
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xtdut(金币+5,VIP+0):非常感谢您的回复!您也说了优化可以支持接着算,那能量也可以吗?也可以用restart吗?希望能得到您再次耐心地指点。 11-7 08:17
xtdut(金币+5,VIP+0):非常感谢您的回复!您也说了优化可以支持接着算,那能量也可以吗?也可以用restart吗?希望能得到您再次耐心地指点。 11-7 08:17
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优化任务接着继续计算: % chk=Yourcheckfilename # B3LYP/6-31G(d) opt=restart Title 0 1 或者 % chk=Yourcheckfilename # B3LYP/6-31G(d) opt geom=check guess=read Title 0 1 如果是频率计算,g09前的版本不支持接着算,g09计算时需要chk文件,命令行要写savenm |
6楼2009-11-06 17:49:37
wuy069
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9楼2009-11-09 09:38:51













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