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seeker91

木虫 (文坛精英)


[交流] 构建新质粒载体

基于蓝白斑筛选载体PUC57构建一种新的载体,此载体在LacZ的下游融合进一个致死基因CCDB,此基因在大肠杆菌内表达后会产生CCDB蛋白,此蛋白能灭活DNA旋转酶,从而导致宿主的死亡,因此,凡是有外源基因插入的载体宿主存活,没有外源基因片段插入的载体宿主死亡,即只要宿主存活,就说明载体连入了外源基因,简化了蓝白斑筛选。
本人从文献上得知这一原理,也进行过实验,但实验结果令人百思不得其解,发现存活的个体也有未插入片段的载体,或者载体本身在转换过程中被破坏。现请教广大虫友,不吝赐教,出谋划策,援手相助!
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

★ ★
amisking(金币+2,VIP+0): 10-26 19:08
个人认为关键在于融合进的致死基因CCDB是否在大肠杆菌里面表达了。如果转进改基因,大肠杆菌不表达,就没取到筛选的作用了。
Thank-you,so-blue.
2楼2009-10-26 12:50:40
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seeker91

木虫 (文坛精英)


引用回帖:
Originally posted by susizheng at 2009-10-26 12:50:
个人认为关键在于融合进的致死基因CCDB是否在大肠杆菌里面表达了。如果转进改基因,大肠杆菌不表达,就没取到筛选的作用了。

可以考虑!!
请继续发言!!
3楼2009-10-26 13:11:32
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zier1011

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+3,VIP+0): 10-26 19:09
1.致死基因连进去后,重组质粒转化大肠杆菌怎么生长?他不是让宿主致死了吗?
2.如果你是提取空的质粒后,先连接了CCDB,然后有连接了其他的目的片段,最后再做转化,你怎么就能保证你的CCBD就一定正确连接了呢?难道要把两段基因都连接之后测序?
3.如果你只是看了连接后的片段长度,那并不能说明CCBD连接进去就一定有活性的,我们平常在做克隆表达时,不是很多时候都没有活性的吗,要挑很多转化子,才有可能找到有表达的重组子,而且未必有活性!
4.因此说,凭什么说连接进去的CCBD就一定能表达并且有活性呢?
5.或者有其他的方法保证连接正确和表达成功并肯定有活性?等回答
花还香香的
4楼2009-10-26 15:07:42
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

引用回帖:
Originally posted by zier1011 at 2009-10-26 15:07:
1.致死基因连进去后,重组质粒转化大肠杆菌怎么生长?他不是让宿主致死了吗?
2.如果你是提取空的质粒后,先连接了CCDB,然后有连接了其他的目的片段,最后再做转化,你怎么就能保证你的CCBD就一定正确连接了呢? ...

你都没有理解楼主说的什么意思,就提出一堆问题
问题1:
楼主并不是要克隆CCDB致死基因,而是将CCDB 作为反向选择标志,CCDB融合在LacZ下游,当没有外源片段插入时可以跟LacZ融合表达,如果没有CCDB基因,长出来的菌落表现为蓝色,这是传统的蓝白斑筛选,现在在其下游融合CCDB致死基因,没有外源基因插入是,直接致死菌,提高筛选效率。
问题2:
楼主的CCDB基因是预先构建在载体上,怎么就不能保证正确连接呢,如果不是正确连接的,拿他来做实验还有什么意义啊。

[ Last edited by gyesang on 2009-10-26 at 17:11 ]
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2009-10-26 16:56:23
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seeker91

木虫 (文坛精英)


引用回帖:
Originally posted by zier1011 at 2009-10-26 15:07:
1.致死基因连进去后,重组质粒转化大肠杆菌怎么生长?他不是让宿主致死了吗?
2.如果你是提取空的质粒后,先连接了CCDB,然后有连接了其他的目的片段,最后再做转化,你怎么就能保证你的CCBD就一定正确连接了呢? ...

ccdb 只在宿主大肠杆菌内能表现出致死这一特性,在其它宿主如DB3.1内是不表现致死特性的。因此可以再DB3.1内获得重组质粒。
构建这一载体,只需在原有PUC57的基础上插入CCDB基因便可,只要LacZ表达,ccdb就能表达,因此按理说来,ccdb是可以表达的。但实验结果有些难以验证这样的理论!纳闷!!
不好意思,忙晕了头,回的晚了!!!
6楼2009-10-26 16:58:24
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
不过不知道为什么有CCDB基因存在,还能长出空载体出来,这个问题还有待证实,我用的T-blunt一种T载体上,也是带有CCDB基因的,但总是有空载体长出来,不过我没有进空载体送去测序一探究竟,毕竟不是专门做这个东西的,最后筛选到我的阳性克隆也就行了,希楼主能把问题搞清楚,然后为大家解惑啊
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
7楼2009-10-26 17:15:26
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seeker91

木虫 (文坛精英)


对了,我这个新质粒已经完全测通了,序列完全正确!!
4楼兄弟说的两个问题很对!
就是在使用的过程中,别的基因片段有时只连进去几个碱基,有时一个也连不上还把质粒本身给破坏了,要么坏几个碱基,要么坏一段碱基!
想不通呀!!!!!!!!!!!!!!!
8楼2009-10-26 17:27:59
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zier1011

木虫 (著名写手)


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引用回帖:
Originally posted by gyesang at 2009-10-26 16:56:

你都没有理解楼主说的什么意思,就提出一堆问题
问题1:
楼主并不是要克隆CCDB致死基因,而是将CCDB 作为反向选择标志,CCDB融合在LacZ下游,当没有外源片段插入时可以跟LacZ融合表达,如果没有CCDB基因,长出 ...

1.我的疑问就是CCBD融合表达之后,怎么得到这个质粒的扩增,CCBD和lacz融合表达后有没有致死作用,有的话你怎么得到这个质粒的扩增?我的疑问在这里!
2.还是这呀,CCBD本来就构建在质粒里,那么这个质粒就会使宿主致死,所以没办法的到这个质粒的扩增呀。

你还是留给我同样的疑问啦,还好seeker回答了我的问题,谢谢啦!
DB3.1不是大肠杆菌吗?那是什么菌?我没做过致死基因选择,也没接触到这个菌株,劳烦回答下

[ Last edited by zier1011 on 2009-10-26 at 20:38 ]
花还香香的
9楼2009-10-26 20:32:01
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zier1011

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
谢谢楼主,学习了,我的疑惑也终于解开了,
花还香香的
10楼2009-10-26 20:41:34
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