| 查看: 482 | 回复: 3 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
【求助】charmm中的RTF与PSF两个力场文件
|
|||
|
问一个比较愚蠢的问题，请指点。 charmm中的RTF与PSF两个力场文件 是怎么建立的啊。 [ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:40 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有3人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有3人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
bay__gulf
金虫 (著名写手)
刘苏州
- 模拟EPI: 8
- 应助: 9 (幼儿园)
- 贵宾: 4.85
- 金币: 2332.8
- 红花: 1
- 帖子: 1344
- 在线: 271小时
- 虫号: 592012
- 注册: 2008-09-03
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
|
rtf , residue topology file, 之中存储了各种基团的原子电荷和键连信息 是力场的一部分 psf , protein structure file, 之中存储了所要考察的体系的原子电荷和键连信息 是体系结构的一部分 可以根据pdb 和rtf 生成这个体系的psf , 两种方法: 用charmm 或用namd/vmd 的psfgen pdb + rtf --(charmm,psfgen)--> psf 展开来说问题极多, 可以参考 http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/2.7b1/ug/node16.html |
2楼2009-10-15 08:19:33
rhyme_xie
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3009.9
- 散金: 85
- 红花: 2
- 帖子: 133
- 在线: 91.7小时
- 虫号: 388139
- 注册: 2007-05-31
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
3楼2009-10-15 09:50:48
bay__gulf
金虫 (著名写手)
刘苏州
- 模拟EPI: 8
- 应助: 9 (幼儿园)
- 贵宾: 4.85
- 金币: 2332.8
- 红花: 1
- 帖子: 1344
- 在线: 271小时
- 虫号: 592012
- 注册: 2008-09-03
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
4楼2009-10-15 10:37:10
20