24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1277  |  回复: 20
当前主题已经存档。

fykxy_206

木虫 (正式写手)

[交流] pcr测序的结果BLAST后没有相似序列??

我用的英文文献上的引物做的PCR,跑出条带后250bp,和文献中的条带大一点,送去测序,测序的结果显示在NCBI中的几个数据库中BLAST没有和我的序列相似的序列,这是为什么呢?我不是很愿意相信我的序列是新序列,谁能帮我分析一下呢?
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fykxy_206

木虫 (正式写手)

怎么没有人知道呢?金币不是问题啊!
2楼2009-10-14 15:44:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


fykxy_206(金币+1,VIP+0):有引物序列,我不是很想要新序列! 10-15 08:15
做了克隆再测序的吗?有没有发现引物序列?
3楼2009-10-14 16:21:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nnxqwei

至尊木虫 (职业作家)


fykxy_206(金币+1,VIP+0):新序列对我没有多大用,我想要的序列不是那个啊! 10-15 08:16
如果你的测序没问题的话,数据库里没有与你序列相似的,那么有可能你得到是一个新的序列哦。。。
4楼2009-10-15 00:09:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fykxy_206

木虫 (正式写手)

继续求助!!
5楼2009-10-15 08:17:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独头蒜8779

木虫 (小有名气)


fykxy_206(金币+1,VIP+0):我试过了,只有20多个碱基与数据库的有相似其他的都不相似。 10-15 09:09
可以取你这个片段里的一部分,比如说一个表位,看下数据库里有没有
数据库这东西还是比较死的
但按LZ说的,连相似的序列都没有,那可真要仔细研究研究了
6楼2009-10-15 08:26:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paulajjh

木虫 (著名写手)

★ ★
fykxy_206(金币+2,VIP+0):我的测序长度是230左右,只有两断长约20bp的有相似的。其他没有同源性可言。用的是宝生物的Taq酶,经两次测序结果相同。 10-15 09:12
你说的没有和你的一样的序列,那同源性最高的是多少啊?有没可能你的PCR中发生突变,你用的什么酶啊?或者测序结果不可信。最后一种可能你的是新序列。那就恭喜LZ了
7楼2009-10-15 08:39:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


fykxy_206(金币+1,VIP+0):是非特异性的扩增?我用引物在BLAST中比对过,特异性很好,只要有就应该是这个基因的一部分吧? 10-15 12:25
如果有引物序列,但引物之间的又不是你要的,答案就是非特异扩增
其实我不大相信文献引物的……还是自己设计的放心
8楼2009-10-15 09:22:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bioxixi

木虫 (著名写手)


fykxy_206(金币+1,VIP+0):为什么是扩增的问题?我的复性温度53,应该不会使非特异扩增吧? 10-15 12:26
没有相似的序列?
很奇怪啊 引物有没?
再做一次或另挑一个克隆测序呢
应该是扩增的问题吧
9楼2009-10-15 09:31:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fykxy_206

木虫 (正式写手)

扩增的序列比如说是这样的顺序:1234567890和数据库中的序列0987654321比对能显示是100%的相似吗?我的意思是说我测序的顺序如果是反的,那能比对出来吗?
10楼2009-10-15 12:31:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 fykxy_206 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工调剂 10+11 下一站上岸@ 2026-04-10 38/1900 2026-04-13 09:03 by lhj2009
[考研] 材料299专硕求调剂 +11 +21 2026-04-09 11/550 2026-04-13 08:57 by lhj2009
[考研] 求调剂 +9 吃口冰激凌 2026-04-07 9/450 2026-04-13 08:46 by 紫曦紫棋
[考研] 22408 352分求调剂 +5 努力的夏末 2026-04-09 5/250 2026-04-12 19:17 by wj165256
[考研] 0854调剂 +12 长弓傲 2026-04-09 13/650 2026-04-12 09:56 by 逆水乘风
[考研] 316求调剂 +5 想读研究生( ?∵ 2026-04-07 5/250 2026-04-12 00:43 by 蓝云思雨
[考研] 22专硕求调剂 +6 haoyun上岸 2026-04-11 8/400 2026-04-11 23:21 by labixiaoqiao
[考研] 085400 328分 求调剂 +10 喂你一个大橙子 2026-04-09 14/700 2026-04-11 19:53 by lqspecial
[考研] 农学0904 312求调剂 +6 Say Never 2026-04-10 6/300 2026-04-11 10:33 by wwj2530616
[考研] 346,工科求调剂 +3 moser233 2026-04-09 3/150 2026-04-11 10:04 by zhq0425
[考研] 一志愿北理工298英一数二已上岸,感谢各位老师 +14 Reframe 2026-04-10 16/800 2026-04-10 23:07 by caotw2020
[考研] 一志愿矿大,材料工程专硕314分,0856可调都可以 +15 无懈可击的巨人 2026-04-09 15/750 2026-04-10 18:10 by hmn_wj
[考研] 初试261 +3 Asht少 2026-04-10 6/300 2026-04-10 16:38 by Asht少
[论文投稿] mdpi小修rvr时间四五天了 20+3 哈哈high 2026-04-08 5/250 2026-04-10 16:02 by 北京莱茵润色
[考研] 327求调剂 +10 Xxjc1107. 2026-04-06 11/550 2026-04-09 01:21 by lature00
[考研] 0703化学调剂 348分 +14 唉我超真没招了 2026-04-06 15/750 2026-04-08 19:16 by 我减肥1
[考研] 一志愿吉大化学327求调剂 +12 王王白石 2026-04-06 13/650 2026-04-08 16:05 by luoyongfeng
[考研] 一志愿哈工大,初试329,求环境科学与工程调剂! +11 余未辛 2026-04-06 11/550 2026-04-08 15:21 by screening
[考研] 287分求调剂 有专利国奖一志愿哈工大085406 +6 白易辰 2026-04-06 7/350 2026-04-06 22:46 by 875465
[考研] 求助 +3 卡卡东88 2026-04-06 4/200 2026-04-06 15:28 by going home
信息提示
请填处理意见