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汕头大学海洋科学接受调剂
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fykxy_206

木虫 (正式写手)

[交流] pcr测序的结果BLAST后没有相似序列??

我用的英文文献上的引物做的PCR,跑出条带后250bp,和文献中的条带大一点,送去测序,测序的结果显示在NCBI中的几个数据库中BLAST没有和我的序列相似的序列,这是为什么呢?我不是很愿意相信我的序列是新序列,谁能帮我分析一下呢?
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


fykxy_206(金币+1,VIP+0):有引物序列,我不是很想要新序列! 10-15 08:15
做了克隆再测序的吗?有没有发现引物序列?
3楼2009-10-14 16:21:21
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fykxy_206

木虫 (正式写手)

怎么没有人知道呢?金币不是问题啊!
2楼2009-10-14 15:44:04
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nnxqwei

至尊木虫 (职业作家)


fykxy_206(金币+1,VIP+0):新序列对我没有多大用,我想要的序列不是那个啊! 10-15 08:16
如果你的测序没问题的话,数据库里没有与你序列相似的,那么有可能你得到是一个新的序列哦。。。
4楼2009-10-15 00:09:49
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独头蒜8779

木虫 (小有名气)


fykxy_206(金币+1,VIP+0):我试过了,只有20多个碱基与数据库的有相似其他的都不相似。 10-15 09:09
可以取你这个片段里的一部分,比如说一个表位,看下数据库里有没有
数据库这东西还是比较死的
但按LZ说的,连相似的序列都没有,那可真要仔细研究研究了
6楼2009-10-15 08:26:48
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