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【求助】mm_pbsa计算 已有2人参与
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现在在做mm_pbsa计算，提取snapshot时用的是“单一轨迹”方法，一开始提取的是1001-2000之间的100幅，采用一套参数计算完毕，后修改参数计算同样的snapshot时出错，更改snapshot的提取范围为1000-1999同样提取100幅，这倒好，不论用修改后还是修改前参数计算均出错，切出错信息均如下： ======== Setting up Grid Parameters ======== Using bounding box for grid setup Bounding Box Center: 41.500 31.000 44.000 Xmin, Xmax, Xmax-Xmin: 34.847 48.429 13.582 Ymin, Ymax, Ymax-Ymin: 24.429 37.517 13.088 Zmin, Zmax, Zmax-Zmin: 41.477 46.439 4.962 beginning box center at level 1 41.500 31.000 44.000 beginning box center at level 2 41.500 31.000 44.000 Grid dimension at level 1 9 9 3 Grid origin corrected at level 1 21.500 11.000 36.000 Grid dimension at level 2 41 41 25 Grid origin corrected at level 2 31.000 20.500 37.500 PB Bomb in setgrd(): focusing grid too large 2 reset fillratio to a larger number 2.000 差别就是出在不同的配体snapshot上，我就纳闷了：复合物的能计算，为啥配体的不能？大家有碰到这种情况吗？怎么解决？万分谢谢！ [ Last edited by zdhlover on 2009-11-13 at 19:14 ] |
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