24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 1503  |  回复: 16
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

fanxing001

铜虫 (小有名气)

[交流] 细菌16s rDNA测序的问题

各位,我做细菌16s rDNA的测定,选择了F27和R1492的通用引物,测序前算了一下,结果应该是1492-27=1465个碱基,拿去测序后,发现结果只有1200个碱基(如图),是不是测序人员看到后面结果比较乱就自动停止测序了啊?还有,我给公司打电话,他们说只保证前几百个碱基结果没问题,那我用这几百个碱基序列去BLAST,去判断该细菌所属的种属,结果是否依然具有说服力?

[ Last edited by amisking on 2009-9-24 at 21:16 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
为什么不测两个反应呢?这样不就可以保证测出来的都是正确的了吗?
5楼2009-09-24 21:17:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

fykxy_206

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+3,VIP+0): 9-24 21:13
测序的结果显示有重叠的峰,应该是菌有污染。你重新做一次,PCR的东西要灭菌,操作戴手套。细菌很容易污染。

电泳图有吗?有跟目的条带一样大小的带吗?

如果是一条带和目的条带一样,建议做个克隆试试。
2楼2009-09-24 17:55:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanxing001

铜虫 (小有名气)

应该没问题,前几百个序列图没问题,只是后面的由于太长,所以无法得到很齐整的峰。
3楼2009-09-24 20:47:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

annwt

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
500-800是有效的,其他的不保证正确。技术高了应该是600-800左右,
4楼2009-09-24 21:10:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085801电气专硕272求调剂 +17 电气李 2026-04-13 19/950 2026-04-15 12:47 by 西北望—风沙
[考研] 药学求调剂 +10 RussHu 2026-04-12 12/600 2026-04-15 12:02 by zhping515
[考研] 药学求调剂 +11 喽哈加油 2026-04-14 13/650 2026-04-14 21:14 by qingfeng258
[考研] 0854调剂 +11 长弓傲 2026-04-12 14/700 2026-04-14 16:07 by 逆水乘风
[考研] 本科211,报考085601-310分 +16 ararak 2026-04-13 16/800 2026-04-14 14:55 by Delta2012
[考研] 一志愿华南理工大学331分材料求调剂 +10 天下ww 2026-04-09 11/550 2026-04-13 23:25 by pies112
[考研] B区0809 ,数一英一,290 求调剂 +3 泠潍1111 2026-04-12 4/200 2026-04-13 20:35 by 学员JpLReM
[基金申请] 2026 WR青拔 +3 冬日阳光CAS 2026-04-09 6/300 2026-04-13 18:40 by liuchb715
[考研] 0854调剂 +10 长弓傲 2026-04-11 11/550 2026-04-13 10:38 by wp06
[教师之家] 山东双非院校考核超级无底线,领导幸灾乐祸,教师遭殃恐 +3 qut2026 2026-04-11 7/350 2026-04-12 20:24 by qut2026
[考研] 280求调剂 +7 兮兮夜夜 2026-04-09 10/500 2026-04-12 00:33 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂 +3 胃痉挛累了 2026-04-11 5/250 2026-04-11 14:13 by luhong1990
[考研] 087100初试311求调剂 +4 任雅琴 2026-04-09 4/200 2026-04-11 10:33 by zhq0425
[考研] 22408调剂求助 +7 毂12 2026-04-09 9/450 2026-04-11 09:23 by 哦哦123
[考研] 085506-求调剂-285分 +3 雷欧飞踢 2026-04-08 3/150 2026-04-11 08:37 by zhq0425
[考研] 一志愿华东师范生物学326分,求调剂 +8 刘墨墨 2026-04-09 8/400 2026-04-10 12:00 by pengliang8036
[考研] 292求调剂 +9 笑笑袁 2026-04-09 9/450 2026-04-10 10:05 by LHGeng
[考研] 349学科化学045106求调剂,化学类都可以 +8 保好懂懂 2026-04-08 8/400 2026-04-09 14:03 by xulei3024
[考研] 招收有机化学、化工,药学,食品灯专业学生 +3 yrfhjgdj 2026-04-08 3/150 2026-04-09 10:15 by QYQX_123
[考研] 085404,334分,求调剂 +5 sunjie8888 2026-04-08 8/400 2026-04-09 07:26 by sunjie8888
信息提示
请填处理意见