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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】请问DS2.1跑完动力学之后，求平均结构出现问题
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arthurii

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请问DS2.1跑完动力学之后，求平均结构出现问题

跑完之后，我只知道用Analyze Trajectory可以看变化程度那些。
如果要分析平均结构，除了手动看运动轨迹自己总结以外，有自动求平均的工具吗？
[这个已经解决]
找了这个选项，但是运行出现一个提示框，没有结果。
提示框信息在6楼。
请教

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:23 ]
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1楼 2009-08-28 14:06:37
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arthurii

木虫 (正式写手)
★ ★
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 9-8 21:53
问题已经解决，
顺便总结一下,为了和我一样不会的同志……让人笑话了……
求平均结构：Scripts-->Structure Editing-->Calculate Average structure
计算前最好把动力学的conformation尽量减少点，因为好容易死机……水，离子可以去除了再算，貌似删的太干净就会有提示不给算……
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9楼2009-09-08 21:24:57
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arthurii

木虫 (正式写手)
……我感觉应该有，但是没找到
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3楼2009-08-28 19:12:22
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
arthurii(金币+1):谢谢参与
yjcmwgk(金币+1,VIP+0):谢谢 8-29 13:59
我觉得，应该是用运动轨迹的最低点的构像。
赞一下(7人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
4楼2009-08-29 11:49:19
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童心

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
arthurii(金币+1):谢谢参与
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):谢谢你的耐心 8-29 16:51
arthurii(金币+4,VIP+0):多谢MM，多次提供帮助 8-29 17:01
现在DS2.5里面有个这个功能的，这下手头没开ds，印象里面就是script那个？就是大菜单栏里面有个分析结合构象下面同时有这个
赞一下(9人) 回复此楼
5楼2009-08-29 16:20:44
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