24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 512  |  回复: 8
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

arthurii

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请问DS2.1跑完动力学之后,求平均结构出现问题

跑完之后,我只知道用Analyze Trajectory可以看变化程度那些。
如果要分析平均结构,除了手动看运动轨迹自己总结以外,有自动求平均的工具吗?
[这个已经解决]
找了这个选项,但是运行出现一个提示框,没有结果。
提示框信息在6楼。
请教

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:23 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

童心

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
arthurii(金币+1):谢谢参与
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):谢谢你的耐心 8-29 16:51
arthurii(金币+4,VIP+0):多谢MM,多次提供帮助 8-29 17:01
现在DS2.5里面有个这个功能的,这下手头没开ds,印象里面就是script那个?就是大菜单栏里面有个分析结合构象下面同时有这个
5楼2009-08-29 16:20:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

arthurii

木虫 (正式写手)

……我感觉应该有,但是没找到
3楼2009-08-28 19:12:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
arthurii(金币+1):谢谢参与
yjcmwgk(金币+1,VIP+0):谢谢 8-29 13:59
我觉得,应该是用运动轨迹的最低点的构像。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
4楼2009-08-29 11:49:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

arthurii

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 童心 at 2009-8-29 16:20:
现在DS2.5里面有个这个功能的,这下手头没开ds,印象里面就是script那个?就是大菜单栏里面有个分析结合构象下面同时有这个

Thank you very much. 找到了,
那个目录下的,
Calculate Average Structure吧?
我用的DS2.1,提示一个东西

There are 1 item(s) with conformations.
Warning: The API Mdm::Molecule::Label has been renamed to Mdm::Molecule::Name, which will automacally be called until the script is updated.Please refer to the documentation and update your scripts to use the renamed API instead.at file line 48 in access to Label.

Work on: 2HY9 with 1000 conformation(s).
This script will create an average conformation.

Number of atoms in conformation is different.

然后什么其他的都没出来。我看这段东西看的不是很懂,求教。

[ Last edited by arthurii on 2009-8-29 at 17:20 ]
6楼2009-08-29 16:57:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 284求调剂 +20 让我上岸吧阿西 2026-04-09 20/1000 2026-04-15 14:40 by 黑科技花岗岩
[考研] 297工科调剂? +14 河南农业大学-能 2026-04-13 15/750 2026-04-15 13:25 by 黑科技矿业
[考研] 一志愿华中农业071010,320求调剂 +10 困困困困坤坤 2026-04-14 11/550 2026-04-15 12:45 by 西北望—风沙
[考研] 恳请有学校收留 +3 柯淮然 2026-04-12 3/150 2026-04-14 16:25 by 逆水乘风
[考研] 290求调剂 +21 luoziheng 2026-04-10 23/1150 2026-04-14 15:49 by zs92450
[考研] 食品与营养(0955)271求调剂 +15 升格阿达 2026-04-12 16/800 2026-04-14 13:18 by 浮若_安生
[考研] 085408光电信息工程专硕355一志愿长春光机所调剂 +6 王ymaa 2026-04-13 13/650 2026-04-14 11:33 by 王ymaa
[考研] 一志愿鲁东大学071000生物学学硕初试分数276求调剂 +8 慕绝cc 2026-04-09 8/400 2026-04-13 14:08 by 张zhihao
[考研] 考研二轮调剂 +10 故人?? 2026-04-09 10/500 2026-04-13 09:55 by szhize
[考研] 0831一轮调剂失败求助 +10 小熊睿睿_s 2026-04-11 10/500 2026-04-12 22:43 by 长弓傲
[考研] 2本,初试303,0860求调剂 +6 floriea 2026-04-12 8/400 2026-04-12 18:13 by zhouxiaoyu
[考研] 药学专硕调剂 +8 ? 一路生?花? 2026-04-10 10/500 2026-04-11 21:21 by zhouxiaoyu
[考研] 086003调剂求助 +21 苏弋万 2026-04-09 22/1100 2026-04-11 20:25 by dongdian1
[考研] 085600材料与化工329分求调剂 +16 叶zilin 2026-04-10 16/800 2026-04-11 11:04 by may_新宇
[考研] 农业管理302分求调剂 +3 xuening1 2026-04-10 3/150 2026-04-11 10:18 by zhq0425
[考研] 0854调剂 +8 950824he@ 2026-04-09 8/400 2026-04-11 10:11 by zhq0425
[考研] 材料与化工调剂 +12 否极泰来2026 2026-04-10 13/650 2026-04-11 00:28 by wangjihu
[考研] 机械专368 有去处吗 +4 种大树 2026-04-10 4/200 2026-04-10 15:31 by jiajinhpu
[考研] 青岛科技大学材料学院,环境学院调剂补录4月10日以前都可以 +3 1青科大。 2026-04-09 5/250 2026-04-10 09:58 by 翩翩一书生
[考研] 一志愿中科院105500专业总分315求调剂 +6 lallalh 2026-04-09 7/350 2026-04-09 17:51 by lallalh
信息提示
请填处理意见