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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】请问DS2.1跑完动力学之后，求平均结构出现问题
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arthurii

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请问DS2.1跑完动力学之后，求平均结构出现问题

跑完之后，我只知道用Analyze Trajectory可以看变化程度那些。
如果要分析平均结构，除了手动看运动轨迹自己总结以外，有自动求平均的工具吗？
[这个已经解决]
找了这个选项，但是运行出现一个提示框，没有结果。
提示框信息在6楼。
请教

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:23 ]
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1楼 2009-08-28 14:06:37
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arthurii

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 童心 at 2009-8-30 11:53:
印象里面2.1没这个吧？ms这个是2.5的功能？不过看你的warning，你这个script好像有点问题吧，这个导致你说的没有结果

2.1有这个选项，但是出现过那个warning，也不是每次都出现，就是把杂原子去掉了就出现这个。

具体这个功能2.1是不是能用我不是很清楚，结构是有的，但就完全不是平均结构，只是conformation的最后一帧
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8楼2009-08-30 12:49:46
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查看全部 9 个回答

arthurii

木虫 (正式写手)
……我感觉应该有，但是没找到
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3楼2009-08-28 19:12:22
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
arthurii(金币+1):谢谢参与
yjcmwgk(金币+1,VIP+0):谢谢 8-29 13:59
我觉得，应该是用运动轨迹的最低点的构像。
赞一下(7人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
4楼2009-08-29 11:49:19
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童心

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
arthurii(金币+1):谢谢参与
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):谢谢你的耐心 8-29 16:51
arthurii(金币+4,VIP+0):多谢MM，多次提供帮助 8-29 17:01
现在DS2.5里面有个这个功能的，这下手头没开ds，印象里面就是script那个？就是大菜单栏里面有个分析结合构象下面同时有这个
赞一下(9人) 回复此楼
5楼2009-08-29 16:20:44
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