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spiderboy

金虫 (正式写手)

[交流] 用cDNA做模板PCR扩不出来……

我用cDNA做模板扩1.4K和2.6K的片段,扩了很多次都扩不出来。。
退火温度用过55度和50度。。。
请问是哪出了问题。。
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+2,VIP+0):欢迎发帖交流! 8-22 20:54
自我感觉cDNA质量怎么样?

可以试试多重PCR,有可能你第一次P出来的量太少,跑电泳基本上看不到条带。

将PCR结果做个稀释比如1X 10X ,取1ul为模板再PCR。

或者你可以试试touchdown PCR ,我PCR不出东西的时候,最先都是用这两种方法重

新PCR,往往能够奏效。

祝好运。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2009-08-22 20:48:04
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spiderboy

金虫 (正式写手)

谢谢!对于楼上你说的第一个方法,因模板少,第二次扩的时候还要再稀释吗?
3楼2009-08-22 21:50:16
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fishing2939

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
要稀释的
建议验证一下模板
4楼2009-08-22 22:16:20
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微笑漩涡

新虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+0,VIP+0):欢迎发帖交流! 8-23 13:16
引用回帖:
Originally posted by spiderboy at 2009-8-22 21:50:
谢谢!对于楼上你说的第一个方法,因模板少,第二次扩的时候还要再稀释吗?

同时作几个梯度的PCR

只需要第一次PCR产物 2ul 就够了。

第一个PCR为1ul为模板,第二个为剩下的1ul稀释10倍 100倍 后各取1ul为模板。

祝好运。
5楼2009-08-23 00:39:43
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小瞥

铁虫 (小有名气)

一般cDNA 要稀释,还有,你的目的片段挺大的,不行要降低退火温度
6楼2009-08-23 13:06:13
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tancf

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+2,VIP+0):欢迎发帖交流! 8-26 19:06
PCR没有结果,很多因素是要考虑的。
你觉得你的模板怎么样呢i?如果不敢肯定的话,不妨先去测序看看。
引物也是比较关键的,重新用软件核对一下,看看有没有大问题。
对于PCR体系,要注意各个组分的量的范围,这个你可以查查PCR的技术方面的说明,它会告诉你各个组分的量的范围。
7楼2009-08-23 14:07:00
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spiderboy

金虫 (正式写手)

谢谢楼上的各位,实验仍在尝试中
8楼2009-08-26 18:59:44
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gogen

金虫 (小有名气)

;cDNA P不出来有可能是摸板纯度问题~~换个酶试试?
9楼2009-08-26 23:40:29
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