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繁梦倾城

新虫 (小有名气)

[求助] 琼脂糖凝胶电泳拖尾,急求解决方案! 已有1人参与

从肉葡萄球菌中提取质粒,跑电泳未出现质粒条带却严重亮带拖尾,请教大神这是为什么?
具体方法如下:
1.将肉葡萄球菌(Staphylococcus carnosus)ATCC 51365培养12~16h,移取2mL菌液于EP管中,12000rpm离心2min,弃去上清液,用滤纸吸取残留的液体。加入100μL 50mg/mL的溶菌酶、20μL 1mg/mL溶葡萄球菌素于37℃、180rpm作用90min,然后按照传统提取质粒的方法提取肉葡萄球菌的质粒。
2.向留有菌体沉淀的离心管中加入250 μl Buffer P1(请先检查Buffer P1是否已经加入RNase A),用移液器或涡旋振荡混匀。
3.向步骤2中加入250 μl Buffer P2,温和的上下颠倒混匀8 - 10 次,使菌体充分裂解。
?4.向步骤3中加入350 μl Buffer P3,立即温和地上下颠倒8 - 10次让溶液彻底中和Buffer P2。
5.将FastPure DNA Mini Columns吸附柱置于Collection Tube 2 ml收集管中。将步骤4上清用移液器小心转移至吸附柱中,注意不要吸到沉淀,12,000 rpm(13,400 × g)离心30 - 60 sec。倒掉收集管中的废液,把吸附柱重新放回收集管中。
6.(可选)加入500 μl Buffer PW1 至吸附柱中。12,000 rpm(13,400 × g)离心30 - 60 sec。弃废液,把吸附柱重新放回收集管中。
▲注意:如果宿主菌是end A+(TG1,BL21, HB101,JM系列, ET12567等),这些宿主菌含有大量的核酸酶,易降解质粒DNA,推荐采用此步。
如果宿主菌是endA-宿主菌(DH5α,TOP10等),此步可省略。
7.加入600 μl Buffer PW2(请检查是否已用无水乙醇稀释)至吸附柱中。12,000 rpm(13,400 × g)离心30 - 60 sec。弃废液,将吸附柱重新放回收集管中。
8.重复步骤7。
9.将吸附柱放回收集管中。12,000 rpm(13,400 × g)离心1 min干燥吸附柱,目的是将吸附柱中残留的漂洗液彻底去除。
10. 把吸附柱置于一个新的灭菌的1.5 ml 离心管中。加入30 - 100 μl Elution Buffer 至柱吸附柱的膜中央。室温静置2 min,12,000 rpm(13,400 × g)离心1 min洗脱DNA。
11. 弃去吸附柱,DNA产物保存于-20℃,以防止DNA降解。
Ps:但是第6步没有做,不知道有没有关系

琼脂糖凝胶电泳拖尾,急求解决方案!


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ahsoarli

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骑牛逛街

方而不割廉而不刿直而不肆光而不耀
2楼2021-06-23 09:01:13
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繁梦倾城

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ahsoarli at 2021-06-23 09:01:13
拖尾就是降解了

谢谢回复,我还想问下这有可能是因为提质粒的过程中降解了吗

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3楼2021-06-23 16:14:31
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jmqt7140

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

4楼2021-12-23 13:46:09
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周东浩129

新虫 (正式写手)

请问楼主构建好的载体转化进et12567里面,多久会降解啊,

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5楼2022-01-11 12:57:51
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