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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 真菌的ITS区长度可以是300bp吗？
汕头大学海洋科学接受调剂
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xiaoxiaolu1777

金虫 (初入文坛)

[交流] 真菌的ITS区长度可以是300bp吗？

我用真菌的通用引物ITS1和ITS4扩增它的ITS区，得到了非特异的条带，其中有长度为300bp左右的条带，我想问一下高手们，真菌的ITS区长度可以是300bp吗？
因为我是用的降解纤维素的复合菌系直接扩增的，所以如果想通过测序直接证明，必须建库，比较费时费力。
所以我想问一下对这方面比较熟悉的高手，可以给我提供文献来证明吗？
非常感谢
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1楼 2009-08-11 17:09:49
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tanlaixun
★
xiaoxiaolu1777(金币+1):谢谢参与
顶。。。。
2楼2009-08-11 18:35:24
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amisking

荣誉版主 (文坛精英)

优秀区长优秀版主
★
xiaoxiaolu1777(金币+1):谢谢参与
建议金币还是手动发送的好！
赞一下(1人) 回复此楼
如果没有人帮助你，那么你就去帮助别人。
3楼2009-08-11 18:44:53
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司马诸葛

木虫 (正式写手)
★
xiaoxiaolu1777(金币+1):谢谢参与
顶一个
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4楼2009-08-11 18:57:35
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userhung

禁虫 (文学泰斗)

木虫博士
★
xiaoxiaolu1777(金币+1):谢谢参与
手动发送哦~~~
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5楼2009-08-11 22:05:05
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louyiceng

荣誉版主 (知名作家)

优秀版主
★
xiaoxiaolu1777(金币+1):谢谢参与
帮你顶一下
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6楼2010-02-18 13:17:30
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695

木虫 (职业作家)
★
xiaoxiaolu1777(金币+1):谢谢参与
这个接触的有点少，帮你顶下，希望早日找到答案
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7楼2010-02-18 16:25:25
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
★
xiaoxiaolu1777(金币+1):谢谢参与
http://www.baidu.com/s?wd=5.8S%B3%A4%B6%C8
5．8S长度为160多bp，通用引物分别依靠18和28S基因序列来设计，所以长度应该由两个可变区来决定。我做过的超过20个真菌结果都是约600bp，鉴定结果多属于曲霉属和枝孢属，其它几属个别分布，但长度与楼主所述相差甚远。可能是楼主的真菌两个可变区确实很短，或者是非特异性PCR造成。试着改变一下退火温度，最好是有梯度PCR，效率高一些。
赞一下(1人) 回复此楼
流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
8楼2010-02-18 16:49:31
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
什么嘛，原来是旧帖，楼主应该早就解决问题了。
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流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
9楼2010-02-18 16:50:47
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匿名

用户注销 (著名写手)
★
xiaoxiaolu1777(金币+1):谢谢参与
本帖仅楼主可见
赞一下
10楼2010-02-18 17:23:35
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