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[交流]
真菌的ITS区长度可以是300bp吗？
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我用真菌的通用引物ITS1和ITS4扩增它的ITS区，得到了非特异的条带，其中有长度为300bp左右的条带，我想问一下高手们，真菌的ITS区长度可以是300bp吗？ 因为我是用的降解纤维素的复合菌系直接扩增的，所以如果想通过测序直接证明，必须建库，比较费时费力。 所以我想问一下对这方面比较熟悉的高手，可以给我提供文献来证明吗？ 非常感谢 |
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3楼2009-08-11 18:44:53
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xiaoxiaolu1777(金币+1):谢谢参与
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http://www.baidu.com/s?wd=5.8S%B3%A4%B6%C8 5．8S长度为160多bp，通用引物分别依靠18和28S基因序列来设计，所以长度应该由两个可变区来决定。我做过的超过20个真菌结果都是约600bp，鉴定结果多属于曲霉属和枝孢属，其它几属个别分布，但长度与楼主所述相差甚远。可能是楼主的真菌两个可变区确实很短，或者是非特异性PCR造成。试着改变一下退火温度，最好是有梯度PCR，效率高一些。 |
8楼2010-02-18 16:49:31
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9楼2010-02-18 16:50:47