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xiaoxiaolu1777

金虫 (初入文坛)

[交流] 真菌的ITS区长度可以是300bp吗?

我用真菌的通用引物ITS1和ITS4扩增它的ITS区,得到了非特异的条带,其中有长度为300bp左右的条带,我想问一下高手们,真菌的ITS区长度可以是300bp吗?
因为我是用的降解纤维素的复合菌系直接扩增的,所以如果想通过测序直接证明,必须建库,比较费时费力。
所以我想问一下对这方面比较熟悉的高手,可以给我提供文献来证明吗?
非常感谢
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

什么嘛,原来是旧帖,楼主应该早就解决问题了。
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
9楼2010-02-18 16:50:47
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amisking

荣誉版主 (文坛精英)

优秀区长优秀版主


xiaoxiaolu1777(金币+1):谢谢参与
建议金币还是手动发送的好!
如果没有人帮助你,那么你就去帮助别人。
3楼2009-08-11 18:44:53
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695

木虫 (职业作家)


xiaoxiaolu1777(金币+1):谢谢参与
这个接触的有点少,帮你顶下,希望早日找到答案
7楼2010-02-18 16:25:25
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶


xiaoxiaolu1777(金币+1):谢谢参与
http://www.baidu.com/s?wd=5.8S%B3%A4%B6%C8
5.8S长度为160多bp,通用引物分别依靠18和28S基因序列来设计,所以长度应该由两个可变区来决定。我做过的超过20个真菌结果都是约600bp,鉴定结果多属于曲霉属和枝孢属,其它几属个别分布,但长度与楼主所述相差甚远。可能是楼主的真菌两个可变区确实很短,或者是非特异性PCR造成。试着改变一下退火温度,最好是有梯度PCR,效率高一些。
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
8楼2010-02-18 16:49:31
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