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【转帖】XCrySDen 软件下载和安装说明
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XCrySDen 软件下载和安装说明 原帖地址:http://forum.hongcam.net/viewthr ... &extra=page%3D1 刚刚安装了XCrySDen 软件,本来一开始是想看vasp的结果的,但是不知道怎么看,yangjinrong_lon兄要是用过,不妨过来说说 这个软件的下载网址是http://www.xcrysden.org/Download.html#pre1.6里面有各种版本的,我安装的是xc-1.5.17-xc-1.5.17-linux_x86-semishared.tar.gz.tar.gz版本,我已经安装过,显示没有问题,安装过程比较简单,因为是tar文件所以不用安装,只需要设置一些环境变量即可。 下面是安装过程: 1.首先解压缩tar文件 tar zxvf xc-1.5.17-xc-1.5.17-linux_x86-semishared.tar.gz.tar.gz 2. 进入XCrySDen-1.5.17-bin-semishared文件夹,执行./xcConfigure.sh 然后会问你一些问题,你只要简单的选择Y和N就行了。 3. 设置环境变量 vi .bashrc XCRYSDEN_TOPDIR=/public/all/XCrySDen-1.5.17-bin-shared XCRYSDEN_SCRATCH=/tmp/XCRYSDEN_SCRATCH export XCRYSDEN_TOPDIR XCRYSDEN_SCRATCH PATH="$XCRYSDEN_TOPDIR:$PATH:$XCRYSDEN_TOPDIR/scripts:$XCRYSDEN_TOPDIR/util" 4.保存bashrc 文件 source .bashrc 5.运行,只需输入xcrysden即可 ,linux系统需要x显示软件,比如xwin,exceed,Xmanager等等 6.在配置过程中,会告诉你要实现一些功能需要哪些额外的软件,下面是地址,有兴趣的可以去下载 XCRYSDEN uses a few external utility programs. These are the following: 1.) the "Open Babel" program is needed to display molecular structure from Gaussian Z-matrix file. 2.) the ImageMagick's suit of programs is used to print-to-file (PNG/JPG/GIF/...), to create animated-GIFs, and to screen dump windows. 3.) the "Mplayer's mencoder" program is used to create AVI/MPEG movies from the animation snapshots. 4.) xcrysden may also use other programs such as gifsicle, xwd, ppmtompeg, ... Open BABEL: http://openbabel.org/ IMAGEMAGICK: http://www.imagemagick.org/ MENCODER: http://www.mplayerhq.hu/ 7.功能简单介绍,下面是转载量子化学网的描述 http://www.materialssimulation.com/node/447 简介 显示晶体和分子的结构和电子密度程序。它还可以处理倒格子空间的特性,如绘制能带结构图,显示Fermi面,等。 功能 晶体和分子的特性分析(如,原子上的力) 显示分子模型(线图,棒图,球棍模型,曲面模型......;转动,平移,放大......) 测量模型的键长,键角和二面角 显示晶体的Wigner-Seitz晶胞和布里渊区 读取标准格式的分子结构文件:XYZ,PDB,XSF 制作动画 提供晶体从头计算程序CRYSTAL的图形用户界面 晶体从头计算程序WIEN的晶体结构可视化,产生二维/三维电子密度,生成用于键结构图的k-网格 显示从头计算程序GAUSSIAN,CRYSTAL,PWSCF,WIEN,FHI98MD计算的结构 XCrySDen 1.6的新功能: 1. 兼容Quantum-Espresso 4.x,WIEN2k_08,和CRYSTAL06。 2. 支持几种电影编码器。 3. 改善了测量过程,选择原子更容易。 4. 实时获取显示图像,存为电影。 5. 鼠标滚轮支持缩放显示。 6. 简化了安装过程。 x86 版下载地址: http://d.namipan.com/d/xc-1.5.17 ... 7788a9ad2272254ce00 |
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