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chenyuchen

木虫 (正式写手)


[交流] 服务器上计算,图形界面及图像处理问题思考

在大型服务器上远程计算,一般是不可能有X-window的,那么对涉及图形界面的软件,比如wien2k,pwscf,大家一般都如何做的?
      当然wien2k的w2web并非必须,有一定经验的都完全可以不用,只需要一个cif结构文件就可以完全利用命令行初始化了。vasp和pwscf等输入文件都是可以完全不借助于图形界面的。但是对于初学者wien2k的w2web和pwscf的图形界面对于初始化参数的选择还是很有帮助的。如果,初学者一开始就是使用服务器远程计算,没有图形界面并且不熟悉linux操作的是比较难学的。我最开始是使用实验室局域网下的小cluster学习的wien2k,觉得上手还是容易很多。pwscf的图形界面也是很有帮助的。
    另外,即使输入文件不需要图形界面,对于Xcrysden(至少支持wien2k和pwscf)这类的画图软件又该如何做呢?比如画电荷密度图,费米面等。
     一种方法当然是在服务器上计算,得到画图需要的文件,然后下载到自己电脑上画图。这 样就需要一台安装了linux的本地电脑,最方便的就是自己使用的终端就是安装linux系统的,因为像xcrysden这类的图像处理软件一般都只支持linux系统的。如果习惯于windows处理日常事务的,可能安装cygwin是最好的选择。当然,我没用过cygwin,但是据我了解cygwin下的程序编译似乎要困难一些,至少是和通用的linux distribution编译是不太相同的。
    所以,感觉我还没有找到最方便的方法,所以在这里向大家请教,大家一般都用什么方法解决图像处理问题的呢?

谢谢!
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
chenyuchen(金币+2): 谢谢关注 2011-04-22 15:34:34
我是这样的:

实际上我有两台电脑,一个是八核的,装linux;另外一个是一般PC,windos.

linux开通ftp。用路由器相连。两块屏幕就摆在我的桌子上。

我寻思,要是能够有一个可以自由活动的悬挂折叠式显示屏就好了。
2楼2011-04-22 12:44:56
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
chenyuchen(金币+2): 2011-04-22 15:39:33
只要服务器开了xsever,就可以远程使用gui.一般服务器都开了的.
3楼2011-04-22 14:08:34
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chenyuchen

木虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by 锐利的碎片 at 2011-04-22 14:08:34:
只要服务器开了xsever,就可以远程使用gui.一般服务器都开了的.

我根据您的说法,搜索了一下,Putty+Xming就能实现你说的远程使用gui。但是我使用的上海超算中心工程师说不能配置X-window,或许我要再和他们联系一下。
另外,还请教一下:这样配置好后,图像处理传输的数据是不是还是挺大?一般互联网网速,会卡吗?
局域网内我也是使用X-windows远程登录的。
4楼2011-04-22 15:45:19
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by 锐利的碎片 at 2011-04-22 14:08:34:
只要服务器开了xsever,就可以远程使用gui.一般服务器都开了的.

你是说,我可以用我的PC打开我的linux服务器上的图形界面?那PC端用什么终端?
5楼2011-04-22 16:47:20
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by chenyuchen at 2011-04-22 15:45:19:
我根据您的说法,搜索了一下,Putty+Xming就能实现你说的远程使用gui。但是我使用的上海超算中心工程师说不能配置X-window,或许我要再和他们联系一下。
另外,还请教一下:这样配置好后,图像处理传输的数据 ...

xming我这里很卡,一般gui像gedit还好,xcrysden就卡到不能用。数据量根据不同终端软件也不一样,优化的好的话还不算大。
6楼2011-04-22 19:31:58
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
chenyuchen(金币+1): 2011-04-22 23:27:46
我是直接用linux机子,然后ssh -X过去
7楼2011-04-22 19:58:07
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
chenyuchen(金币+1): 2011-04-22 23:29:17
Xmanager
    由于相对于Windows系统具有更好的安全性和稳定性,Linux系统已广泛应用于大型企业应用中。通常情况下,我们都期望通过远程的方式对服务器主机进行控制和管理,一方面避免长时间呆在嘈杂的服务器机房中;另一方面,如果服务器相对分散,或待管理的服务器主机数量众多时,在不同的主机间进行管控必然浪费大量的时间和精力,所以,通过远程的方式对服务器主机进行管理是一种很好的方法。

    对服务器主机进行远程控制通常会借助工具,如果是对主机进行文本模式下的管理,有很多优秀的工具都可以实现,如SecureCRT、SSH等,这些工具通过选择合适的通信协议,输入正确的用户名和密码,完成相应的配置即可实现与远程主机的连接。但是如果希望对远程主机进行图形化界面的管理,上述工具均由于无法开启窗口服务的进程或程序,而无法实现远程窗口管理。因此,本文介绍一种利用X manager工具远程以图形化方式管理Linux的方法。

    Xmanager一是款运行在Windows上的简单高效的X Server软件,它提供与UNIX应用程序实现通信的接口,可运行于视窗环境中,其最重要的功能即是可以将远程Unix/Linux桌面通过窗口的方式“移植”到Windows操作系统上,实现在Windows上对远程Unix/Linux进行图形化管理,通过选择协议,Xmanager甚至可以跨越防火墙,实现与远程主机相连。无论你使用的是GNOME,还是KDE桌面环境,只是其是X系统,都可以使用这种方式图形化管理远程主机,唯一不同的配置上稍有差异。

    Xmanager安装完成后,通常包括五类产品,分别是:Xbrowser、Xconfig、Xmanager-Broadcast、Xmanager-Passive和Xstart,在此仅对Xbrowser连接远程服务器的过程和配置进行简要介绍。在介绍如何使用Xbrowser连接远程主机之前,首先需在Linux操作系统中完成必要的设置。

http://www.cstc.org.cn/tabid/1231/InfoID/88628/Default.aspx
8楼2011-04-22 20:00:59
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chenyuchen(金币+1): 2011-04-22 23:59:18
使用这个软件可以满足你的需求。
我用过
9楼2011-04-22 20:01:50
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ifmc1234

木虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
chenyuchen(金币+2): 2011-04-22 23:29:38
“因为像xcrysden这类的图像处理软件一般都只支持linux系统的。”
有window的啊

cygwin安装还是很方便的,软件编译也行。不过不要用它来计算了,windows下的效率太差了。而且内存也提不上去。

pwscf有window版的图形界面的。
10楼2011-04-22 21:34:51
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chenyuchen

木虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by wuli8 at 2011-04-22 20:00:59:
Xmanager
    由于相对于Windows系统具有更好的安全性和稳定性,Linux系统已广泛应用于大型企业应用中。通常情况下,我们都期望通过远程的方式对服务器主机进行控制和管理,一方面避免长时间呆在嘈杂的服务器机房 ...

这个我用过,在局域网有时候就有点卡,远程的话正如上面说的应该会很卡。
11楼2011-04-22 23:28:40
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chenyuchen

木虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by ifmc1234 at 2011-04-22 21:34:51:
“因为像xcrysden这类的图像处理软件一般都只支持linux系统的。”
有window的啊

cygwin安装还是很方便的,软件编译也行。不过不要用它来计算了,windows下的效率太差了。而且内存也提不上去。

pwscf有wind ...

支持wien2k和pwscf的xcrysden在windows下必须有cygwin环境吧?
改天还是试试cygwin吧!
最近我看过一点儿cygwin,国内有下载镜像吗?
我不太清楚到底需要哪些部分,所以免得麻烦,我想完全安装,即使不下载那些很大的说明性文档,源代码下载好像也得1G啊,国际流量要收钱的,我怕被老板骂,所以没敢下。倒是在一个论坛里下了一个1.7的,号称完全版,不知道如何。另外,我再找找有没有国内的源,呵呵。
你能根据你的经验,推荐一下大的安装列表?能实现一般数据和图像处理就行了,谢谢!
12楼2011-04-22 23:58:43
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chenyuchen

木虫 (正式写手)


找到了一个cygwin中文站点,目前下载速度还行100KB/s
http://cygwin.wardking.com/
13楼2011-04-23 00:16:08
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ifmc1234

木虫 (著名写手)



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chenyuchen(金币+1): 2011-04-23 13:37:22
引用回帖:
Originally posted by chenyuchen at 2011-04-22 23:58:43:
支持wien2k和pwscf的xcrysden在windows下必须有cygwin环境吧?
改天还是试试cygwin吧!
最近我看过一点儿cygwin,国内有下载镜像吗?
我不太清楚到底需要哪些部分,所以免得麻烦,我想完全安装,即使不下载 ...

安装列表有点忘了。也太多了。
你可以先试着下最少的,就是默认的
并在此基础上去掉部分。
我们不是按流量的,所以我只忘多的装。。。

假如安装后缺了库,到时再可以进行选择行下载更新就好了。
14楼2011-04-23 08:37:38
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
chenyuchen(金币+1): 2011-04-23 13:38:20
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Originally posted by 锐利的碎片 at 2011-04-22 19:31:58:
xming我这里很卡,一般gui像gedit还好,xcrysden就卡到不能用。数据量根据不同终端软件也不一样,优化的好的话还不算大。

我也是这个问题,卡到不能用
17楼2011-04-23 12:26:47
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chenyuchen

木虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by ifmc1234 at 2011-04-23 08:37:38:
安装列表有点忘了。也太多了。
你可以先试着下最少的,就是默认的
并在此基础上去掉部分。
我们不是按流量的,所以我只忘多的装。。。

假如安装后缺了库,到时再可以进行选择行下载更新就好了。

我找到国内的镜像了,已经完全下载了,所以准备全给装上。
18楼2011-04-23 13:37:59
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
XCRYSDEN对格式很敏感么?为什么之前的文件能用xcrysden打开,等我去掉一个空格之后就不能打开了,然后我把去掉的空格再加上也不能打开了 这是怎么回事呢
20楼2011-04-30 19:24:45
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