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chenyuchen

木虫 (正式写手)

[交流] 服务器上计算，图形界面及图像处理问题思考

在大型服务器上远程计算，一般是不可能有X-window的，那么对涉及图形界面的软件，比如wien2k，pwscf，大家一般都如何做的？
      当然wien2k的w2web并非必须，有一定经验的都完全可以不用，只需要一个cif结构文件就可以完全利用命令行初始化了。vasp和pwscf等输入文件都是可以完全不借助于图形界面的。但是对于初学者wien2k的w2web和pwscf的图形界面对于初始化参数的选择还是很有帮助的。如果，初学者一开始就是使用服务器远程计算，没有图形界面并且不熟悉linux操作的是比较难学的。我最开始是使用实验室局域网下的小cluster学习的wien2k，觉得上手还是容易很多。pwscf的图形界面也是很有帮助的。
    另外，即使输入文件不需要图形界面，对于Xcrysden（至少支持wien2k和pwscf）这类的画图软件又该如何做呢？比如画电荷密度图，费米面等。
     一种方法当然是在服务器上计算，得到画图需要的文件，然后下载到自己电脑上画图。这 样就需要一台安装了linux的本地电脑，最方便的就是自己使用的终端就是安装linux系统的，因为像xcrysden这类的图像处理软件一般都只支持linux系统的。如果习惯于windows处理日常事务的，可能安装cygwin是最好的选择。当然，我没用过cygwin，但是据我了解cygwin下的程序编译似乎要困难一些，至少是和通用的linux distribution编译是不太相同的。
    所以，感觉我还没有找到最方便的方法，所以在这里向大家请教，大家一般都用什么方法解决图像处理问题的呢？

谢谢！
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1楼 2011-04-22 11:42:41
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
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chenyuchen(金币+2): 谢谢关注 2011-04-22 15:34:34
我是这样的：

实际上我有两台电脑，一个是八核的,装linux;另外一个是一般PC,windos.

linux开通ftp。用路由器相连。两块屏幕就摆在我的桌子上。

我寻思，要是能够有一个可以自由活动的悬挂折叠式显示屏就好了。
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2楼2011-04-22 12:44:56
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)
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chenyuchen(金币+2): 2011-04-22 15:39:33
只要服务器开了xsever,就可以远程使用gui.一般服务器都开了的.
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3楼2011-04-22 14:08:34
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chenyuchen

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 锐利的碎片 at 2011-04-22 14:08:34:
只要服务器开了xsever,就可以远程使用gui.一般服务器都开了的.

我根据您的说法，搜索了一下，Putty+Xming就能实现你说的远程使用gui。但是我使用的上海超算中心工程师说不能配置X-window，或许我要再和他们联系一下。
另外，还请教一下：这样配置好后，图像处理传输的数据是不是还是挺大？一般互联网网速，会卡吗？
局域网内我也是使用X-windows远程登录的。
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4楼2011-04-22 15:45:19
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
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引用回帖:
Originally posted by 锐利的碎片 at 2011-04-22 14:08:34:
只要服务器开了xsever,就可以远程使用gui.一般服务器都开了的.

你是说，我可以用我的PC打开我的linux服务器上的图形界面？那PC端用什么终端？
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5楼2011-04-22 16:47:20
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)
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引用回帖:
Originally posted by chenyuchen at 2011-04-22 15:45:19:
我根据您的说法，搜索了一下，Putty+Xming就能实现你说的远程使用gui。但是我使用的上海超算中心工程师说不能配置X-window，或许我要再和他们联系一下。
另外，还请教一下：这样配置好后，图像处理传输的数据 ...

xming我这里很卡,一般gui像gedit还好，xcrysden就卡到不能用。数据量根据不同终端软件也不一样，优化的好的话还不算大。
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6楼2011-04-22 19:31:58
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bingmou

金虫 (著名写手)
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chenyuchen(金币+1): 2011-04-22 23:27:46
我是直接用linux机子，然后ssh -X过去
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7楼2011-04-22 19:58:07
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wuli8

荣誉版主 (知名作家)
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chenyuchen(金币+1): 2011-04-22 23:29:17
Xmanager
    由于相对于Windows系统具有更好的安全性和稳定性，Linux系统已广泛应用于大型企业应用中。通常情况下，我们都期望通过远程的方式对服务器主机进行控制和管理，一方面避免长时间呆在嘈杂的服务器机房中；另一方面，如果服务器相对分散，或待管理的服务器主机数量众多时，在不同的主机间进行管控必然浪费大量的时间和精力，所以，通过远程的方式对服务器主机进行管理是一种很好的方法。

    对服务器主机进行远程控制通常会借助工具，如果是对主机进行文本模式下的管理，有很多优秀的工具都可以实现，如SecureCRT、SSH等，这些工具通过选择合适的通信协议，输入正确的用户名和密码，完成相应的配置即可实现与远程主机的连接。但是如果希望对远程主机进行图形化界面的管理，上述工具均由于无法开启窗口服务的进程或程序，而无法实现远程窗口管理。因此，本文介绍一种利用X manager工具远程以图形化方式管理Linux的方法。

    Xmanager一是款运行在Windows上的简单高效的X Server软件，它提供与UNIX应用程序实现通信的接口，可运行于视窗环境中，其最重要的功能即是可以将远程Unix/Linux桌面通过窗口的方式“移植”到Windows操作系统上，实现在Windows上对远程Unix/Linux进行图形化管理，通过选择协议，Xmanager甚至可以跨越防火墙，实现与远程主机相连。无论你使用的是GNOME，还是KDE桌面环境，只是其是X系统，都可以使用这种方式图形化管理远程主机，唯一不同的配置上稍有差异。

    Xmanager安装完成后，通常包括五类产品，分别是：Xbrowser、Xconfig、Xmanager-Broadcast、Xmanager-Passive和Xstart，在此仅对Xbrowser连接远程服务器的过程和配置进行简要介绍。在介绍如何使用Xbrowser连接远程主机之前，首先需在Linux操作系统中完成必要的设置。

http://www.cstc.org.cn/tabid/1231/InfoID/88628/Default.aspx
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8楼2011-04-22 20:00:59
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wuli8

荣誉版主 (知名作家)
chenyuchen(金币+1): 2011-04-22 23:59:18
使用这个软件可以满足你的需求。
我用过
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9楼2011-04-22 20:01:50
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ifmc1234

木虫 (著名写手)
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chenyuchen(金币+2): 2011-04-22 23:29:38
“因为像xcrysden这类的图像处理软件一般都只支持linux系统的。”
有window的啊

cygwin安装还是很方便的，软件编译也行。不过不要用它来计算了，windows下的效率太差了。而且内存也提不上去。

pwscf有window版的图形界面的。
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10楼2011-04-22 21:34:51
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chenyuchen

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by wuli8 at 2011-04-22 20:00:59:
Xmanager
    由于相对于Windows系统具有更好的安全性和稳定性，Linux系统已广泛应用于大型企业应用中。通常情况下，我们都期望通过远程的方式对服务器主机进行控制和管理，一方面避免长时间呆在嘈杂的服务器机房 ...

这个我用过，在局域网有时候就有点卡，远程的话正如上面说的应该会很卡。
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11楼2011-04-22 23:28:40
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chenyuchen

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by ifmc1234 at 2011-04-22 21:34:51:
“因为像xcrysden这类的图像处理软件一般都只支持linux系统的。”
有window的啊

cygwin安装还是很方便的，软件编译也行。不过不要用它来计算了，windows下的效率太差了。而且内存也提不上去。

pwscf有wind ...

支持wien2k和pwscf的xcrysden在windows下必须有cygwin环境吧？
改天还是试试cygwin吧！
最近我看过一点儿cygwin，国内有下载镜像吗？
我不太清楚到底需要哪些部分，所以免得麻烦，我想完全安装，即使不下载那些很大的说明性文档，源代码下载好像也得1G啊，国际流量要收钱的，我怕被老板骂，所以没敢下。倒是在一个论坛里下了一个1.7的，号称完全版，不知道如何。另外，我再找找有没有国内的源，呵呵。
你能根据你的经验，推荐一下大的安装列表？能实现一般数据和图像处理就行了，谢谢！
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12楼2011-04-22 23:58:43
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chenyuchen

木虫 (正式写手)
找到了一个cygwin中文站点，目前下载速度还行100KB/s
http://cygwin.wardking.com/
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13楼2011-04-23 00:16:08
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ifmc1234

木虫 (著名写手)
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chenyuchen(金币+1): 2011-04-23 13:37:22
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Originally posted by chenyuchen at 2011-04-22 23:58:43:
支持wien2k和pwscf的xcrysden在windows下必须有cygwin环境吧？
改天还是试试cygwin吧！
最近我看过一点儿cygwin，国内有下载镜像吗？
我不太清楚到底需要哪些部分，所以免得麻烦，我想完全安装，即使不下载 ...

安装列表有点忘了。也太多了。
你可以先试着下最少的，就是默认的
并在此基础上去掉部分。
我们不是按流量的，所以我只忘多的装。。。

假如安装后缺了库，到时再可以进行选择行下载更新就好了。
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14楼2011-04-23 08:37:38
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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
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chenyuchen(金币+1): 2011-04-23 13:38:20
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Originally posted by 锐利的碎片 at 2011-04-22 19:31:58:
xming我这里很卡,一般gui像gedit还好，xcrysden就卡到不能用。数据量根据不同终端软件也不一样，优化的好的话还不算大。

我也是这个问题，卡到不能用
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17楼2011-04-23 12:26:47
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chenyuchen

木虫 (正式写手)
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Originally posted by ifmc1234 at 2011-04-23 08:37:38:
安装列表有点忘了。也太多了。
你可以先试着下最少的，就是默认的
并在此基础上去掉部分。
我们不是按流量的，所以我只忘多的装。。。

假如安装后缺了库，到时再可以进行选择行下载更新就好了。

我找到国内的镜像了，已经完全下载了，所以准备全给装上。
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18楼2011-04-23 13:37:59
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identation

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
XCRYSDEN对格式很敏感么？为什么之前的文件能用xcrysden打开，等我去掉一个空格之后就不能打开了，然后我把去掉的空格再加上也不能打开了 这是怎么回事呢
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20楼2011-04-30 19:24:45
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