24小时热门版块排行榜    

查看: 6814  |  回复: 16
【奖励】 本帖被评价11次,作者zhangyunli增加金币 10.2
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhangyunli

金虫 (正式写手)


[资源] 【转帖】XCrySDen 软件下载和安装说明

XCrySDen 软件下载和安装说明
原帖地址http://forum.hongcam.net/viewthr ... &extra=page%3D1

刚刚安装了XCrySDen 软件,本来一开始是想看vasp的结果的,但是不知道怎么看,yangjinrong_lon兄要是用过,不妨过来说说

这个软件的下载网址是http://www.xcrysden.org/Download.html#pre1.6里面有各种版本的,我安装的是xc-1.5.17-xc-1.5.17-linux_x86-semishared.tar.gz.tar.gz版本,我已经安装过,显示没有问题,安装过程比较简单,因为是tar文件所以不用安装,只需要设置一些环境变量即可。



下面是安装过程:

1.首先解压缩tar文件 tar zxvf xc-1.5.17-xc-1.5.17-linux_x86-semishared.tar.gz.tar.gz

2. 进入XCrySDen-1.5.17-bin-semishared文件夹,执行./xcConfigure.sh 然后会问你一些问题,你只要简单的选择Y和N就行了。

3. 设置环境变量 vi .bashrc
XCRYSDEN_TOPDIR=/public/all/XCrySDen-1.5.17-bin-shared
XCRYSDEN_SCRATCH=/tmp/XCRYSDEN_SCRATCH
export XCRYSDEN_TOPDIR XCRYSDEN_SCRATCH
PATH="$XCRYSDEN_TOPDIR:$PATH:$XCRYSDEN_TOPDIR/scripts:$XCRYSDEN_TOPDIR/util"

4.保存bashrc 文件
  source .bashrc

5.运行,只需输入xcrysden即可 ,linux系统需要x显示软件,比如xwin,exceed,Xmanager等等

6.在配置过程中,会告诉你要实现一些功能需要哪些额外的软件,下面是地址,有兴趣的可以去下载
XCRYSDEN uses a few external utility programs. These are the following:
   1.) the "Open Babel" program is needed to display molecular structure from
       Gaussian Z-matrix file.
   2.) the ImageMagick's suit of programs is used to print-to-file (PNG/JPG/GIF/...),
       to create animated-GIFs, and to screen dump windows.
   3.) the "Mplayer's mencoder" program is used to create AVI/MPEG movies
       from the animation snapshots.
   4.) xcrysden may also use other programs such as gifsicle, xwd, ppmtompeg, ...
   Open BABEL:  http://openbabel.org/
   IMAGEMAGICK: http://www.imagemagick.org/
   MENCODER:    http://www.mplayerhq.hu/


7.功能简单介绍,下面是转载量子化学网的描述  
http://www.materialssimulation.com/node/447
简介  
  显示晶体和分子的结构和电子密度程序。它还可以处理倒格子空间的特性,如绘制能带结构图,显示Fermi面,等。
功能  
晶体和分子的特性分析(如,原子上的力)
显示分子模型(线图,棒图,球棍模型,曲面模型......;转动,平移,放大......)
测量模型的键长,键角和二面角
显示晶体的Wigner-Seitz晶胞和布里渊区
读取标准格式的分子结构文件:XYZ,PDB,XSF
制作动画
提供晶体从头计算程序CRYSTAL的图形用户界面
晶体从头计算程序WIEN的晶体结构可视化,产生二维/三维电子密度,生成用于键结构图的k-网格
显示从头计算程序GAUSSIAN,CRYSTAL,PWSCF,WIEN,FHI98MD计算的结构

XCrySDen 1.6的新功能:
1. 兼容Quantum-Espresso 4.x,WIEN2k_08,和CRYSTAL06。
2. 支持几种电影编码器。
3. 改善了测量过程,选择原子更容易。
4. 实时获取显示图像,存为电影。
5. 鼠标滚轮支持缩放显示。
6. 简化了安装过程。

x86 版下载地址: http://d.namipan.com/d/xc-1.5.17 ... 7788a9ad2272254ce00
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
xcrysden打开PWscf的文件是有些小问题的
详情可以看http://blog.sina.com.cn/s/blog_5f15ead20100cwcl.html
4楼2009-08-06 16:43:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

condensed

木虫 (著名写手)


背景太花了,眼花啊,看样是我老了
3楼2009-08-06 15:45:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zdd2008

金虫 (职业作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

不错不错!!!呵呵!顶一个!!!
5楼2009-10-15 20:16:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

这个要顶,背景有点  
6楼2009-10-15 20:26:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +4 Mqqqqqq 2026-03-19 4/200 2026-03-20 14:15 by 星空星月
[考研] 085700资源与环境308求调剂 +10 墨墨漠 2026-03-18 11/550 2026-03-20 11:57 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿 南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕 +4 @taotao 2026-03-20 4/200 2026-03-20 10:37 by EBSD
[考研] 271材料工程求调剂 +7 .6lL 2026-03-18 7/350 2026-03-20 09:10 by xingguangj
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-19 5/250 2026-03-19 23:51 by 23Postgrad
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +5 ioodiiij 2026-03-17 5/250 2026-03-19 18:22 by zcl123
[考研] 266求调剂 +5 阳阳哇塞 2026-03-14 10/500 2026-03-19 15:08 by 阳阳哇塞
[考研] 材料与化工求调剂 +7 为学666 2026-03-16 7/350 2026-03-19 14:48 by 尽舜尧1
[考研] 311求调剂 +6 26研0 2026-03-15 6/300 2026-03-18 14:43 by haxia
[考研] 311求调剂 +11 冬十三 2026-03-15 12/600 2026-03-18 14:36 by 星空星月
[考研] 0854可跨调剂,一作一项核心论文五项专利,省、国级证书40+数一英一287 +8 小李0854 2026-03-16 8/400 2026-03-18 14:35 by 搏击518
[考研] 0703化学336分求调剂 +6 zbzihdhd 2026-03-15 7/350 2026-03-18 09:53 by zhukairuo
[考研] 293求调剂 +11 zjl的号 2026-03-16 16/800 2026-03-18 08:10 by zhukairuo
[考研] 332求调剂 +6 Zz版 2026-03-13 6/300 2026-03-17 17:03 by ruiyingmiao
[考博] 26申博 +4 八6八68 2026-03-16 4/200 2026-03-17 13:00 by 轻松不少随
[考研] 11408 一志愿西电,277分求调剂 +3 zhouzhen654 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:03 by laoshidan
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
信息提示
请填处理意见