24小时热门版块排行榜    

查看: 3287  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

hellohuo

金虫 (小有名气)

[求助] 植物基因敲低表达,用CRISPR还是用RNAi? 已有2人参与

最近想要做植物内某个基因的沉默,一直纠结于用Crispr,还是用传统的RNAi技术,我的目的想要看该基因敲低后的相关生理状态,并不一定非要敲除,担心彻底敲除某个基因会引起其他生理反应,而不是我预期的生理现象。因此,想求教各位大神,这两个技术手段的优缺点,针对我的实验目的,有没有大神可以给点建议?谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hellohuo

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 草溪河 at 2020-11-28 13:31:27
基于你的描述和研究目的,建议还是做RNAi吧。通常来说,RNAi是降低基因的表达量,即knock-down,但不会完全使基因功能丧失(多数情况下),而CRISPR介导的基因敲除(knock-out),顾名思义,通过在基因编码区引入碱 ...

还想请教一下,基于目前所有关于敲低与敲除的实验,感觉用CRISPR的比较多,而RNAi逐渐变少了,是因为RNAi的技术存在某种问题?还是说大家都朝着新技术CRISPR发展?我觉得彻底敲除可能会造成生理功能的其他连锁变化。因为有些基因对于发育还是挺重要的,直接敲除,可能除了它本身的功能,也连带会出现别的生理变化,这种并不能说明连带的功能就是这个基因本身的功能。我觉得别人肯定也有考虑到这个问题,但是为什么大家还选择CRISPR呢?因为我对这个技术不是很了解,所以有哪些原因是我没想到的,求指教!谢谢!!!
3楼2020-12-02 09:14:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

草溪河

铁虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
hellohuo: 金币+5, ★★★很有帮助, 感谢您的回答,明白了很多! 2021-02-20 09:38:45
基于你的描述和研究目的,建议还是做RNAi吧。通常来说,RNAi是降低基因的表达量,即knock-down,但不会完全使基因功能丧失(多数情况下),而CRISPR介导的基因敲除(knock-out),顾名思义,通过在基因编码区引入碱基缺失或插入,造成移码突变或提前终止翻译等,可以实现将基因功能完成丧失。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2020-11-28 13:31:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

草溪河

铁虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hellohuo at 2020-12-02 09:14:29
还想请教一下,基于目前所有关于敲低与敲除的实验,感觉用CRISPR的比较多,而RNAi逐渐变少了,是因为RNAi的技术存在某种问题?还是说大家都朝着新技术CRISPR发展?我觉得彻底敲除可能会造成生理功能的其他连锁变化 ...

大家还选择CRISPR进行基因功能研究,,最主要的还是该技术可以实现基因敲除,更确定地是突变体材料的定制,理论上可以实现任意位点的核苷酸序列的改变(编辑),比如特定的编码区、结构域、顺势作用元件、内含子等。其次,CRISPR技术获得材料最后是可以不含外源T-DNA的,意味着在生产上应用的潜力加大,同时更重要的是可以在此基础上再次进行其他基因的敲除,实现多基因敲除(当合理设计携带多个sgRNA也能轻易地进行多基因敲除)。由于CRIPSR的高特异性,对于相似度极高的同源基因也能很好地实现靶基因的敲除。
选择CRISPR还是RNAi,关键取决于各自的试验内容及目的吧,毕竟这俩只是单纯的技术而已,各有有缺,合理使用即可。
你之前有相关的实验数据表明该基因敲除对发育有严重影响吗?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2020-12-02 12:01:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hellohuo

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 草溪河 at 2020-12-02 12:01:36
大家还选择CRISPR进行基因功能研究,,最主要的还是该技术可以实现基因敲除,更确定地是突变体材料的定制,理论上可以实现任意位点的核苷酸序列的改变(编辑),比如特定的编码区、结构域、顺势作用元件、内含子等 ...

还没开始做那么深层研究,只是查了一下相关文献,是开花相关的基因,因为这个基因主要功能负责开花,如果敲除了,我担心的是除了能够看到后续开花的功能被影响了,也可能会因为开花缺失导致植物碳流分配的问题,这样牵一发动全身。因为我只是想看开花过程中,该基因在负责的那部分功能,因为开花这个生理过程是被多基因调控的,而不是开花的缺失对植物的影响。所以我一直在纠结,主要想敲低该基因功能,但是又不影响植物生存,又能看到该基因对开花的过程的影响。
因为对这两个技术只是听闻过,也查过资料,我不清楚为什么大家都抛弃了RNAi,而选择了CRISPR,是否RNAi存在某种技术缺点,而被停用,还是CRISPR有某些更优势的能力,因为有一些技术层面的东西没有写在文章里,所以想请教请教专业的人,帮忙解惑。
5楼2020-12-08 11:24:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿郑州大学,学硕,物理化学, 333求调剂 +3 李魔女斗篷 2026-03-04 3/150 2026-03-04 10:23 by a不易
[考研] 0703化学 一志愿东北大学 279分求调剂 +3 聂乐平 2026-03-03 3/150 2026-03-04 10:16 by qingfeng258
[考博] 26申博 +5 north, 2026-02-28 5/250 2026-03-04 10:01 by StarAura
[考研] 材料328求调剂 +5 一个萝卜02 2026-03-03 5/250 2026-03-04 09:10 by gaoxiaoniuma
[考研] 347求调剂 +3 啊欧欧欧 2026-03-03 3/150 2026-03-04 08:54 by 每天只摆一小会
[考研] 291求调剂 +3 咕噜咕噜123123 2026-03-02 4/200 2026-03-04 08:39 by 每天只摆一小会
[考研] 291求调剂 +4 Afy123456 2026-03-03 7/350 2026-03-03 22:29 by barlinike
[基金申请] 请问大家,研究风险与应对措施那里, 大家都怎么写呢 ? +3 cauasen 2026-03-02 3/150 2026-03-03 19:43 by Tide man
[考研] 环境调剂 +5 柒槿levana 2026-03-01 5/250 2026-03-03 15:47 by stewie_jz
[考研] 268求调剂 +10 简单点0 2026-03-02 14/700 2026-03-03 14:51 by pingping55
[考研] 材料学硕318求调剂 +15 February_Feb 2026-03-01 17/850 2026-03-03 14:47 by xiaomc_gzh
[考研] 267求调剂 +6 钓鱼佬as 2026-03-02 6/300 2026-03-03 13:59 by 13589
[考研] 课题组接收材料类调剂研究生 +6 gaoxiaoniuma 2026-02-28 9/450 2026-03-03 09:27 by gaoxiaoniuma
[考研] 324求调剂 +4 wxz2 2026-03-03 5/250 2026-03-03 09:25 by 杨杨杨紫
[考研] 288求调剂 +3 少71.8 2026-03-02 5/250 2026-03-03 06:01 by tgxtgxtgx9
[考研] 303求调剂 +5 今夏不夏 2026-03-01 5/250 2026-03-02 15:01 by 向上的胖东
[考研] 295求调剂 +8 19171856320 2026-02-28 8/400 2026-03-02 11:19 by yuchj
[考研] 275求调剂 +3 L-xin? 2026-03-01 6/300 2026-03-02 10:22 by 热情沙漠
[考研] 313求调剂 +3 水流年lc 2026-02-28 3/150 2026-03-01 16:01 by 新能源达人
[论文投稿] Optics letters投稿被拒求助 30+3 luckyry 2026-02-26 4/200 2026-03-01 09:06 by babero
信息提示
请填处理意见