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cindyyue19

金虫 (小有名气)

[交流] 大肠杆菌蛋白表达时用何种方法去除N端甲硫氨酸?

最近想要表达蛋白,想要去掉N端的甲硫氨酸,请问哪位高手能指导一二?
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mritang

新虫 (知名作家)

没有努力,再好的远见也只有是一个不切实际的梦想。努力不懈,才能达到有价值的目标。
2楼2020-09-22 07:08:12
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pennchem

专家顾问 (正式写手)


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细胞表达蛋白后,第一个氨基酸(F-Met)会被deformylase切除。

然鹅,如果表达量大,也有出现该残基不会全被切除,这个时候可以通过融合表达后切除的方法,得到不含F-Met的蛋白。

去掉该残基盒不去掉该残基引起蛋白性质变化很大的情况有,但极少
行至水穷处,坐看云起时
3楼2020-09-22 08:04:34
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zsygxh

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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cindyyue19: 金币+8 2020-09-22 16:58:31
首位的甲酰甲硫氨酸(fMet)在胞内能被部分切除,切除的效率受第二位氨基酸侧链的影响较大,不同序列切割率差异比较大。如果你是想要纯化一些均一的不含fMet的目的蛋白做实验,而不是用于大量生产的话,建议你在序列前面融合能完全切除的标签,比如在前面融合DDDDK,纯化后用肠激酶切除,或者融合sumo标签,用ULP1切除,能得到均一的目的蛋白。
4楼2020-09-22 13:24:19
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cindyyue19

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zsygxh at 2020-09-22 13:24:19
首位的甲酰甲硫氨酸(fMet)在胞内能被部分切除,切除的效率受第二位氨基酸侧链的影响较大,不同序列切割率差异比较大。如果你是想要纯化一些均一的不含fMet的目的蛋白做实验,而不是用于大量生产的话,建议你在序列前 ...

请问您知道大量生产的话,一般用什么方法去除吗?
5楼2020-09-22 17:11:57
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zsygxh

金虫 (小有名气)

★ ★
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cindyyue19: 金币+1 2020-10-07 09:56:36
引用回帖:
5楼: Originally posted by cindyyue19 at 2020-09-22 17:11:57
请问您知道大量生产的话,一般用什么方法去除吗?...

我前面的表述可能有点问题。我本意是想说,如果你是在实验室里,需要几十到几百mg蛋白用于实验研究,那么直接重新构建质粒,在N端连上一个能完全去除的标签就行了,这样简单、方便、高效。如果你是在药企或其它单位,需要大量生产这个蛋白的话,那么需要考虑产量的问题。比如,在菌体表达蛋白总量相当的情况下,融合标签越长,目的蛋白占总蛋白比例就越少,所以产量就越少,而如果你的目的蛋白分子量本身就很小,那影响会更明显。再比如,序列发生变化,表达量也会变化,极端(且常见)情况下甚至不表达。所以如果是生产的情况,建议你尝试构建多种不同的标签,根据实际表达来定夺(需要考虑融合蛋白的表达总量,蛋白结构/活性的变化,副产物对后续工艺的影响等等,比较麻烦)。我前面语境好像在说融合标签不适合生产,其实融合在生物制药生产中是很常见的,这其实只是我表述有问题。其它能够彻底、均一地切除fMet并且不对目的蛋白结构造成影响的方法,目前我不太清楚。

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6楼2020-09-25 16:38:59
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cindyyue19

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by zsygxh at 2020-09-25 16:38:59
我前面的表述可能有点问题。我本意是想说,如果你是在实验室里,需要几十到几百mg蛋白用于实验研究,那么直接重新构建质粒,在N端连上一个能完全去除的标签就行了,这样简单、方便、高效。如果你是在药企或其它单位 ...

谢谢!
7楼2020-10-07 09:56:45
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heylixing

铁虫 (正式写手)


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我们也出现这样的问题,蛋白的甲硫氨酸去除不完全。有文献报道可以使用氨肽酶处理纯化后的蛋白,Aminopeptidase M处理人生长激素(nakagawa1987)。
8楼2020-10-08 22:14:02
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gufu

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你好,请问你最后用的什么方法去除甲硫氨酸呢,我用了标签标记也去不完全,谢谢了!
9楼2021-10-31 11:25:43
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