24小时热门版块排行榜    

查看: 927  |  回复: 4
【悬赏金币】回答本帖问题,作者舞翼hy飘将赠送您 24 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

舞翼hy飘

新虫 (初入文坛)

[求助] 解离常数理论计算已有1人参与

各位前辈,我现在需要计算蛋白和分子的结合能,因为疫情在家条件有限,没有安装gromacs。所以希望用公式binding energy=RT*ln10^(-pKd)来计算结合能。但是其中的解离常数Kd如何获取。目前已经用DS完成了蛋白和分子的对接。

或者,有没有其他比较可靠的计算结合能的方法呢?感谢各位了。

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cngdkpmg

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

用Amber吧,然后算MMPBSA结合自由能,百度搜索《分子动力学教程 分子动力学模拟(Amber 20)》和《【分子动力学教程】结合自由能计算(MM/PB(GB)SA)》。
4楼2021-11-26 19:17:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

小木翔AI

新虫 (著名写手)

2楼2020-03-15 13:16:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木翔AI

新虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小木翔AI at 2020-03-15 13:16:34
mmgbsa

我这边可以进行mmgbsa计算,有兴趣?

发自小木虫Android客户端
3楼2020-03-15 13:18:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnhkice

新虫 (小有名气)

我这边可以帮助计算,有需求私信留个联系方式
5楼2021-12-02 11:28:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 博三一直没文章怎么办 +23 133456 2024-05-17 34/1700 2024-05-20 09:44 by lizhiweiouc
[基金申请] 评审规则突发奇想 +22 平凡冰雪花 2024-05-13 29/1450 2024-05-20 09:23 by sunnyxiao7
[基金申请] 连续3年国社科青年本子都没中,今年最后一次青年了,写本子完全浪费时间 +15 ddkk3000 2024-05-15 20/1000 2024-05-19 21:39 by 德国队我爱你
[考博] 双非博士还是985科研助理,然后再读博 +5 lxdatj123 2024-05-18 7/350 2024-05-19 18:59 by 风云无泪
[硕博家园] 海外博士,国内博后找工作求建议 +8 905452934 2024-05-16 19/950 2024-05-19 17:56 by 她在学习
[教师之家] 来用亲身体会,一起说说年轻老师的辛苦 +19 zylfront 2024-05-17 25/1250 2024-05-19 16:19 by otani
[论文投稿] Nano-Micro Letters投稿可以用PDF上传吗 5+4 962511369 2024-05-18 4/200 2024-05-19 15:47 by ca0yan9
[论文投稿] Angew拒稿重投经历大修返回又送审了 48+3 YOONAZHA 2024-05-18 5/250 2024-05-19 11:28 by nono2009
[硕博家园] 又忍不住想吐槽文科的学术圈 +6 nvizqxuf 2024-05-18 8/400 2024-05-19 10:04 by nvizqxuf
[论文投稿] 求期刊推荐 30+3 jxhx666666 2024-05-15 6/300 2024-05-19 07:31 by 期刊发表 专著出
[基金申请] 河北省基金 +11 3101251516 2024-05-16 18/900 2024-05-18 11:41 by 晓晓爱翠翠
[教师之家] 博士去高校就是为了有寒暑假吗? +16 wenwen0825 2024-05-16 22/1100 2024-05-18 09:57 by 鱼翔浅底1
[考博] 双非院士组还是211普通老师 +9 timergoi 2024-05-14 10/500 2024-05-18 08:31 by 3001160025
[考博] 寻找高分子领域博导 +8 小政雅图 2024-05-14 11/550 2024-05-16 22:10 by 单调的胖子
[分析] 液相色谱基线上移 5+3 江上鸢飞 2024-05-13 3/150 2024-05-16 11:49 by gwmgyp
[教师之家] 加上“青年”两个字,意义就变了 +10 zylfront 2024-05-13 13/650 2024-05-15 23:36 by flasheagle
[基金申请] 青年拔尖出炉 +5 babu2015 2024-05-14 6/300 2024-05-15 21:27 by msjy
[基金申请] 有人看了我的科研之友 +9 jurkat.1640 2024-05-14 12/600 2024-05-15 16:04 by arthas_007
[论文投稿] 第一次投SCI,一审给了Revise +5 慎独的小花卷 2024-05-13 12/600 2024-05-14 20:58 by 慎独的小花卷
[有机交流] 无水硫酸钠除水 50+4 桃桃PXS 2024-05-13 4/200 2024-05-14 17:46 by 小肉干
信息提示
请填处理意见