应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 解离常数理论计算
51/1返回列表
查看: 1542  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

舞翼hy飘

新虫 (初入文坛)

[求助] 解离常数理论计算 已有1人参与

各位前辈，我现在需要计算蛋白和分子的结合能，因为疫情在家条件有限，没有安装gromacs。所以希望用公式binding energy=RT*ln10^（-pKd）来计算结合能。但是其中的解离常数Kd如何获取。目前已经用DS完成了蛋白和分子的对接。

或者，有没有其他比较可靠的计算结合能的方法呢？感谢各位了。

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2020-03-15 10:57:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木翔AI

新虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小木翔AI at 2020-03-15 13:16:34
mmgbsa

我这边可以进行mmgbsa计算，有兴趣?

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2020-03-15 13:18:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

小木翔AI

新虫 (著名写手)
mmgbsa

发自小木虫Android客户端
回复此楼
2楼2020-03-15 13:16:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cngdkpmg

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

用Amber吧，然后算MMPBSA结合自由能，百度搜索《分子动力学教程 分子动力学模拟（Amber 20）》和《【分子动力学教程】结合自由能计算（MM/PB(GB)SA）》。
赞一下 回复此楼
4楼2021-11-26 19:17:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnhkice

新虫 (小有名气)
我这边可以帮助计算，有需求私信留个联系方式
赞一下 回复此楼
5楼2021-12-02 11:28:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售渎SCI文章，我:8⊙ 55 1⊙ 54。备注【⊙=0】 +3 ipys00zm58 2026-03-06 5/250 2026-03-07 03:46 by vwchyxxzm4
[考研] 调剂的同学，走过路过，不要错过 +4 likeihood 2026-03-06 6/300 2026-03-07 01:40 by 大傻狗
[基金申请] 进入个人成果库好难，一下午都没进去 +5 mi_dilee 2026-03-05 5/250 2026-03-06 23:36 by JMS_TU
[考研] 初试297求调剂 +3 一个萝萝 2026-02-28 3/150 2026-03-06 16:37 by @飒飒飒飒
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +4 邱gl 2026-03-06 4/200 2026-03-06 15:51 by 聪明的大松鼠
[考研] 085600材料与化工调剂 280分 +13 yyqqhh 2026-03-03 13/650 2026-03-06 11:29 by 2020015
[考研] 085600，一志愿郑州大学，280分求调剂 +7 Wuqi725 2026-03-05 7/350 2026-03-06 08:12 by 杨杨杨紫
[考研] 材料与化工，291，求调剂 +7 咕噜咕噜123123 2026-03-05 8/400 2026-03-05 20:08 by houyaoxu
[考研] 没上岸的看过来 +3 tangxiaotian 2026-03-01 5/250 2026-03-05 13:56 by tangxiaotian
[考研] 347求调剂 +6 啊欧欧欧 2026-03-03 8/400 2026-03-05 11:40 by 0202liuyan
[考研] 材料类考研调剂 +7 gemmgemm 2026-03-01 8/400 2026-03-05 10:51 by 早安1234
[考研] 环境工程专硕307 一志愿211 四六级已过 求调剂 +5 ccc! 2026-03-03 6/300 2026-03-05 09:42 by 热情沙漠
[考研] 一志愿武汉理工大学-085602-总分296分-求调剂 +7 紫川葡柚 2026-03-04 7/350 2026-03-04 21:04 by kakakapanpan
[考研] 286 +6 ksncj 2026-03-04 6/300 2026-03-04 20:49 by lature00
[考研] 0703化学求调剂 +3 将未有期 2026-03-04 3/150 2026-03-04 16:19 by sslc1985
[考研] 292求调剂 +9 yhk_819 2026-02-28 9/450 2026-03-04 16:06 by sslc1985
[考研] 325求调剂 +5 学家科 2026-03-04 5/250 2026-03-04 14:04 by kakakapanpan
[考研] 289求调剂 +8 yang婷 2026-03-02 10/500 2026-03-04 09:10 by 无际的草原
[考研] 085602化学工程350，调剂，有没有211的 +5 利好利好. 2026-03-02 9/450 2026-03-03 17:06 by 利好利好.
[考研] 化学，材料，环境类求调剂 +7 考研版棒棒 2026-03-02 7/350 2026-03-02 19:56 by hypershenger
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭