24小时热门版块排行榜    

查看: 924  |  回复: 4
【悬赏金币】回答本帖问题,作者舞翼hy飘将赠送您 24 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

舞翼hy飘

新虫 (初入文坛)

[求助] 解离常数理论计算已有1人参与

各位前辈,我现在需要计算蛋白和分子的结合能,因为疫情在家条件有限,没有安装gromacs。所以希望用公式binding energy=RT*ln10^(-pKd)来计算结合能。但是其中的解离常数Kd如何获取。目前已经用DS完成了蛋白和分子的对接。

或者,有没有其他比较可靠的计算结合能的方法呢?感谢各位了。

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木翔AI

新虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小木翔AI at 2020-03-15 13:16:34
mmgbsa

我这边可以进行mmgbsa计算,有兴趣?

发自小木虫Android客户端
3楼2020-03-15 13:18:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

小木翔AI

新虫 (著名写手)

2楼2020-03-15 13:16:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cngdkpmg

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

用Amber吧,然后算MMPBSA结合自由能,百度搜索《分子动力学教程 分子动力学模拟(Amber 20)》和《【分子动力学教程】结合自由能计算(MM/PB(GB)SA)》。
4楼2021-11-26 19:17:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnhkice

新虫 (小有名气)

我这边可以帮助计算,有需求私信留个联系方式
5楼2021-12-02 11:28:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 申请基金代表性成果 +13 lancet0903 2024-05-17 14/700 2024-05-19 22:35 by 手心里的幸福
[考博] 有博导缺学生吗,我可以当牛做马 +35 刘秋彤 2024-05-13 60/3000 2024-05-19 22:19 by 刘秋彤
[有机交流] 除DMSO +3 Spiralup 2024-05-15 4/200 2024-05-19 22:03 by 化研迅
[考博] 考博跨专业可以跨多远 +5 竹外。。。 2024-05-18 6/300 2024-05-19 21:51 by 摩天思瑞
[考博] 双非博士还是985科研助理,然后再读博 +5 lxdatj123 2024-05-18 7/350 2024-05-19 18:59 by 风云无泪
[教师之家] 执念 +7 459582015 2024-05-16 8/400 2024-05-19 18:22 by Quakerbird
[硕博家园] 又见奇葩学生,可咋办 +22 appleapple2 2024-05-17 26/1300 2024-05-19 13:52 by 起个新名字好难
[论文投稿] 求推荐期刊 20+3 好困好困a 2024-05-18 4/200 2024-05-19 11:30 by nono2009
[硕博家园] 又忍不住想吐槽文科的学术圈 +6 nvizqxuf 2024-05-18 8/400 2024-05-19 10:04 by nvizqxuf
[教师之家] 白天不懂夜的黑,90后青椒与60后老板 +3 zylfront 2024-05-18 4/200 2024-05-18 10:12 by zylfront
[基金申请] 面上评委可能变为7个了,是好是坏呢? +20 suiyuanwgz 2024-05-15 25/1250 2024-05-17 17:05 by 能丫
[基金申请] 青基 +3 变成超人 2024-05-15 4/200 2024-05-17 12:42 by ssxclkj
[硕博家园] 五氯化铌怎么溶解啊 +3 南南枝枝 2024-05-17 5/250 2024-05-17 11:37 by ad_fish
[硕博家园] 领养小孩 +15 Yyds55 2024-05-14 15/750 2024-05-17 09:53 by 田园1983
[有机交流] 无水硫酸钠除水 80+3 桃桃PXS 2024-05-13 5/250 2024-05-17 09:49 by FuMmm
[基金申请] 数理学部函评几号结束? +6 科研孤勇者 2024-05-16 6/300 2024-05-17 08:49 by hudf03
[基金申请] 系统导出申报书中参与人那一页的格式,跨入两页,要通过调整行间距调整到一页吗? +3 danisha 2024-05-15 5/250 2024-05-16 18:21 by danisha
[基金申请] 青年拔尖出炉 +5 babu2015 2024-05-14 6/300 2024-05-15 21:27 by msjy
[职场人生] 硕士毕业四年工作不顺心 +4 noora2018 2024-05-14 4/200 2024-05-15 15:19 by 1158057902
[论文投稿] 七个月了,还在selecting for review +3 g9522 2024-05-14 6/300 2024-05-14 19:00 by lizhengke06
信息提示
请填处理意见