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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】[求助]分子动力学模拟（BOMD）出错问题
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sophy8069

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】[求助]分子动力学模拟（BOMD）出错问题

TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ
  WANTED AN INTEGER AS INPUT.
  FOUND A STRING AS INPUT.
Ti  0                                                                           
                                                                                 
                                                                                 
                 
?
Error termination via Lnk1e in C:\G03W\l118.exe at Wed Jun 03 11:49:25 2009.
这是我的BOMD输出文件，请问出错在哪啊？？
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1楼 2009-06-03 12:00:34
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冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 6-3 18:19
你的输入有问题，请贴出输入文件
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2楼2009-06-03 17:25:35
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sophy8069

银虫 (小有名气)
# b3lyp/gen bomd(update=4,Rtemp=300,stepsize=10000,maxpoints=400)

分子结构部分

Ti  0
6-311++g
****
C  H  0
6-31g
****
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3楼2009-06-03 21:41:32
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xiaowandouer

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 6-3 22:34
sophy8069(金币+2,VIP+0):我觉得你说的可能有影响！请你给我发几个具体不需分裂的例子文件，谢了！ 6-5 15:55
不知道楼主要不要考虑分裂路径的数量？
手册上讲：All BOMD jobs must specify the number of dissociation paths; for many jobs, this value will be zero (a blank line is also allowed), and no other BOMD input will be used.
所以，如果不考虑分裂路径，应该考虑在分子说明后空一行，加个0或者直接在分子说明后空两行，然后再定义基组
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4楼2009-06-03 22:27:24
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 6-4 10:55
引用回帖:
Originally posted by sophy8069 at 2009-6-3 12:00:
TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ

Ti  0                                                            ...

根据你的出错信息和你给出的输入文件
我判断是你在输入文件中没有给出title这一行
导致程序把你的电荷、自旋多重度和输入坐标等当成了title
然后把Ti 0这一行当成了电荷和自旋多重度
电荷的数字要求是整数，因此出现了
"WANTED AN INTEGER AS INPUT.
  FOUND A STRING AS INPUT.”
的出错信息，你需要补全title这一行，格式：

# ...........
                                            空一行
title                                      随便写点什么
                             再空一行
电荷 自旋多重度
分子坐标信息........
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
5楼2009-06-04 09:40:02
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sophy8069

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xiaowandouer at 2009-6-3 22:27:
不知道楼主要不要考虑分裂路径的数量？
手册上讲：All BOMD jobs must specify the number of dissociation paths; for many jobs, this value will be zero (a blank line is also allowed), and no other BOMD ...

我这样试过了，可是还会出现同样的错误。但当我把基组都统一成一个基组就没这个问题了，我不知道这是怎么回事啊？？ 请指点！！
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6楼2009-06-04 11:18:21
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sophy8069

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by hairan at 2009-6-4 09:40:


根据你的出错信息和你给出的输入文件
我判断是你在输入文件中没有给出title这一行
导致程序把你的电荷、自旋多重度和输入坐标等当成了title
然后把Ti 0这一行当成了电荷和自旋多重度
电荷的数字要求是整数 ...

title那一行我写了的，包括在分子结构里了，我没贴出来。
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7楼2009-06-04 11:20:32
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 6-4 20:00
引用回帖:
Originally posted by sophy8069 at 2009-6-4 11:20:

title那一行我写了的，包括在分子结构里了，我没贴出来。

title的上下有空行吗？应该是有且只有一个空行
格式问题一点都不能马虎
从你出错的信息，我还是坚持我的观点
要不你把你的输出文件都贴出来看看，
如果想对分子结构保密，你可以把分子结构第一个原子和最后一个原子之间的部分隐藏

[ Last edited by hairan on 2009-6-4 at 11:34 ]
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
8楼2009-06-04 11:32:15
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poppyly

铁虫 (小有名气)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 6-4 20:00
引用回帖:
Originally posted by sophy8069 at 2009-6-3 12:00:
TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ
  WANTED AN INTEGER AS INPUT.
  FOUND A STRING AS INPUT.
Ti  0                                                            ...

Lz看看输入文件中数字哪里有问题，看看自己的体系，是不是电荷，自旋有问题，或者是分解路径数量
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9楼2009-06-04 13:46:43
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sophy8069

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by hairan at 2009-6-4 11:32:


title的上下有空行吗？应该是有且只有一个空行
格式问题一点都不能马虎
从你出错的信息，我还是坚持我的观点
要不你把你的输出文件都贴出来看看，
如果想对分子结构保密，你可以把分子结构第一个原子和最 ...

%chk=1p.chk
%mem=300MB
%save
%nproc=1
# b3lyp/gen bomd(update=4,Rtemp=285,step=6100)

Title Card Required

0 1
C
分子结构
D14         -151.04903303


Ti  0
6-311++g
****
C  H  0
6-31g
****
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10楼2009-06-04 15:18:42
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