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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】[求助]分子动力学模拟（BOMD）出错问题
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xiaowandouer

木虫 (正式写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 6-4 20:01
建议多看手册
如果还是无法解决的话，可以试着给高斯公司的技术写信询问
老外一般比较认真，会详细的给你解释相关的用法
国内的代理商就不好说了，不过也可一试
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11楼2009-06-04 15:19:41
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冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 6-4 20:01
从你输入可以看出，
D14         -151.04903303


Ti  0
之间至少空两行，你再检查检查，细节决定成败！！
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12楼2009-06-04 15:26:22
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 6-4 20:01
sophy8069(金币+2,VIP+0):谢谢 因为我优化结构时用的这个基组，所以就没变了。请问算BOMD的基组必须和优化此分子结构时用的一样才行吗？？ 6-11 16:26
引用回帖:
Originally posted by sophy8069 at 2009-6-4 15:18:

%chk=1p.chk
%mem=300MB
%save
%nproc=1
# b3lyp/gen bomd(update=4,Rtemp=285,step=6100)

Title Card Required

0 1
C
分子结构
D14         -151.04903303


Ti  0
6-311++g
****
C  H   ...

我试了一下你的输入文件，的确存在输入格式问题，只不过在Ti 0这一行附近，推荐输入格式：
........
0 1
C
分子结构
D14         -151.04903303

0                                               ！ lz注意这一行

Ti  0
6-311++g
****
C  H   0
6-31g
****



另外，对你的基组使用很觉得奇怪，首先对Ti来说，6-311+G和6-311++G没有区别，其次，你的计算为什么不用极化函数，尤其是对过渡金属来说，极化函数是准确描述波函数所必须的。我认为6-31+G(d)要比6-311+G要准确得多。
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
13楼2009-06-04 16:10:08
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poppyly

铁虫 (小有名气)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 6-4 20:01
只要在基组前面空一行加一行0就行了。表示不需要计算什么dissociation path
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14楼2009-06-04 17:43:29
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★
xuefei06(金币+2,VIP+0):3Q! 6-11 19:14
sophy8069(金币+1,VIP+0):谢谢你提供的信息。希望能给我个你的QQ号，以便交流，谢谢。 6-15 16:38
引用回帖:
sophy8069(金币+2,VIP+0):谢谢 因为我优化结构时用的这个基组，所以就没变了。请问算BOMD的基组必须和优化此分子结构时用的一样才行吗？？ 6-11 16:26  ...

回楼主

优化和BOMD倒不一定非要用一样的基组
但是对你的含有过渡金属的体系
最好都用带了极化函数的基组（也就是那个(d)）
优化的时候甚至需要更高角动量的极化基组，比如(2d,2p)或者(3df,2p)等等
而那个加号，也就是弥散函数，如果是中性分子或者正离子，有时不要也行。
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
15楼2009-06-11 18:43:59
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wanglijuan66
16楼2009-06-11 21:12:05
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