应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】[求助]分子动力学模拟（BOMD）出错问题
161/2返回列表12下一页
查看: 1220  |  回复: 15
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

sophy8069

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】[求助]分子动力学模拟（BOMD）出错问题

TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ
  WANTED AN INTEGER AS INPUT.
  FOUND A STRING AS INPUT.
Ti  0                                                                           
                                                                                 
                                                                                 
                 
?
Error termination via Lnk1e in C:\G03W\l118.exe at Wed Jun 03 11:49:25 2009.
这是我的BOMD输出文件，请问出错在哪啊？？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2009-06-03 12:00:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 6-3 18:19
你的输入有问题，请贴出输入文件
赞一下(10人) 回复此楼
2楼2009-06-03 17:25:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sophy8069

银虫 (小有名气)
# b3lyp/gen bomd(update=4,Rtemp=300,stepsize=10000,maxpoints=400)

分子结构部分

Ti  0
6-311++g
****
C  H  0
6-31g
****
赞一下 回复此楼
3楼2009-06-03 21:41:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaowandouer

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 6-3 22:34
sophy8069(金币+2,VIP+0):我觉得你说的可能有影响！请你给我发几个具体不需分裂的例子文件，谢了！ 6-5 15:55
不知道楼主要不要考虑分裂路径的数量？
手册上讲：All BOMD jobs must specify the number of dissociation paths; for many jobs, this value will be zero (a blank line is also allowed), and no other BOMD input will be used.
所以，如果不考虑分裂路径，应该考虑在分子说明后空一行，加个0或者直接在分子说明后空两行，然后再定义基组
赞一下(11人) 回复此楼
4楼2009-06-03 22:27:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 6-4 10:55
引用回帖:
Originally posted by sophy8069 at 2009-6-3 12:00:
TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ

Ti  0                                                            ...

根据你的出错信息和你给出的输入文件
我判断是你在输入文件中没有给出title这一行
导致程序把你的电荷、自旋多重度和输入坐标等当成了title
然后把Ti 0这一行当成了电荷和自旋多重度
电荷的数字要求是整数，因此出现了
"WANTED AN INTEGER AS INPUT.
  FOUND A STRING AS INPUT.”
的出错信息，你需要补全title这一行，格式：

# ...........
                                            空一行
title                                      随便写点什么
                             再空一行
电荷 自旋多重度
分子坐标信息........
赞一下(10人) 回复此楼
据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
5楼2009-06-04 09:40:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sophy8069

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xiaowandouer at 2009-6-3 22:27:
不知道楼主要不要考虑分裂路径的数量？
手册上讲：All BOMD jobs must specify the number of dissociation paths; for many jobs, this value will be zero (a blank line is also allowed), and no other BOMD ...

我这样试过了，可是还会出现同样的错误。但当我把基组都统一成一个基组就没这个问题了，我不知道这是怎么回事啊？？ 请指点！！
赞一下 回复此楼
6楼2009-06-04 11:18:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sophy8069

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by hairan at 2009-6-4 09:40:


根据你的出错信息和你给出的输入文件
我判断是你在输入文件中没有给出title这一行
导致程序把你的电荷、自旋多重度和输入坐标等当成了title
然后把Ti 0这一行当成了电荷和自旋多重度
电荷的数字要求是整数 ...

title那一行我写了的，包括在分子结构里了，我没贴出来。
赞一下 回复此楼
7楼2009-06-04 11:20:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 6-4 20:00
引用回帖:
Originally posted by sophy8069 at 2009-6-4 11:20:

title那一行我写了的，包括在分子结构里了，我没贴出来。

title的上下有空行吗？应该是有且只有一个空行
格式问题一点都不能马虎
从你出错的信息，我还是坚持我的观点
要不你把你的输出文件都贴出来看看，
如果想对分子结构保密，你可以把分子结构第一个原子和最后一个原子之间的部分隐藏

[ Last edited by hairan on 2009-6-4 at 11:34 ]
赞一下(10人) 回复此楼
据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
8楼2009-06-04 11:32:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

poppyly

铁虫 (小有名气)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 6-4 20:00
引用回帖:
Originally posted by sophy8069 at 2009-6-3 12:00:
TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ-TRJ
  WANTED AN INTEGER AS INPUT.
  FOUND A STRING AS INPUT.
Ti  0                                                            ...

Lz看看输入文件中数字哪里有问题，看看自己的体系，是不是电荷，自旋有问题，或者是分解路径数量
赞一下(10人) 回复此楼
9楼2009-06-04 13:46:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sophy8069

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by hairan at 2009-6-4 11:32:


title的上下有空行吗？应该是有且只有一个空行
格式问题一点都不能马虎
从你出错的信息，我还是坚持我的观点
要不你把你的输出文件都贴出来看看，
如果想对分子结构保密，你可以把分子结构第一个原子和最 ...

%chk=1p.chk
%mem=300MB
%save
%nproc=1
# b3lyp/gen bomd(update=4,Rtemp=285,step=6100)

Title Card Required

0 1
C
分子结构
D14         -151.04903303


Ti  0
6-311++g
****
C  H  0
6-31g
****
赞一下 回复此楼
10楼2009-06-04 15:18:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 sophy8069 的主题更新
161/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-09 4/200 2026-03-16 01:21 by Xttdmn
[考研] 一志愿985，本科211，0817化学工程与技术319求调剂 +3 Liwangman 2026-03-15 3/150 2026-03-15 18:16 by JourneyLucky
[考研] 0703 物理化学调剂 +3 我可以上岸的对� 2026-03-13 3/150 2026-03-15 17:32 by 小物理化学
[考研] 294求调剂 +3 Zys010410@ 2026-03-13 4/200 2026-03-15 10:59 by zhq0425
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化，一志愿：哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 211本，11408一志愿中科院277分，曾在中科院自动化所实习 +3 Losir 2026-03-12 3/150 2026-03-14 12:11 by 热情沙漠
[考研] 求调剂 +5 鹤遨予卿 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:44 by JourneyLucky
[考研] 考研材料与化工，求调剂 +8 戏精丹丹丹 2026-03-09 8/400 2026-03-14 01:14 by JourneyLucky
[考研] b区环境工程求调剂 +4 Maps1 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:23 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中科院，化学方向，295求调剂 +4 一氧二氮 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:35 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 315求调剂 +9 小羊小羊_ 2026-03-11 10/500 2026-03-13 21:13 by SXNU李老师
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[硕博家园] 深圳大学硕士招生（2026秋，传感器方向，仅录取第一志愿） +4 xujiaoszu 2026-03-11 7/350 2026-03-13 17:28 by xujiaoszu
[考研] 310求调剂 +3 【上上签】 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:16 by JourneyLucky
[考研] 0857 资源与环境 285分 +6 未名考生 2026-03-09 6/300 2026-03-11 21:08 by 30660438
[考研] 0857环境调剂 +5 熠熠_11 2026-03-10 5/250 2026-03-11 10:59 by wang_dand
[考研] 大连大学化学专业研究生调剂 +3 琪久. 2026-03-10 8/400 2026-03-11 10:02 by 琪久.
[考研] 调剂 +5 呵唔哦豁 2026-03-10 5/250 2026-03-10 22:00 by 28375m
[硕博家园] 木虫好像不热闹了，是不是？ +4 偏振片 2026-03-10 4/200 2026-03-10 09:51 by longwave
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭