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承太郎

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各位大神,我想问一下转录组测序后得到的差异基因进行blast,然后选出一些基因进行功能验证,我想问一下这些基因的可信度高吗?我做了4个基因,老板说太少,可能转到拟南芥里没表型。我大概要选多少个基因比较合适。

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西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2019-07-14 21:45:18
楼主选定候选基因的时候不是光看表达差异了吧,至少还得结合gene 功能,通路分析,以及聚类分析的之类吧。
另外,选定了候选gene,一般也都是再跑个qPCR来验证一下RNA-seq的结果,然后再做转gene。毕竟转gene实验周期长,尽量要用多种方法排除那些不靠谱的。
至于四个够不够,主要就是看你的前期结果找到多少,以及看你在有限的时间内和有限的资源内能做多少。没有什么绝对的标准。
17楼2019-07-13 10:44:54
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2019-07-13 00:01   回复  
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jixiangbao10楼
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111小鸟13楼
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