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承太郎

新虫 (小有名气)
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转录组测序
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各位大神，我想问一下转录组测序后得到的差异基因进行blast，然后选出一些基因进行功能验证，我想问一下这些基因的可信度高吗？我做了4个基因，老板说太少，可能转到拟南芥里没表型。我大概要选多少个基因比较合适。

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1楼 2019-07-12 23:56:20
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TE225

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西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2019-07-14 21:45:18
楼主选定候选基因的时候不是光看表达差异了吧，至少还得结合gene 功能，通路分析，以及聚类分析的之类吧。
另外，选定了候选gene，一般也都是再跑个qPCR来验证一下RNA-seq的结果，然后再做转gene。毕竟转gene实验周期长，尽量要用多种方法排除那些不靠谱的。
至于四个够不够，主要就是看你的前期结果找到多少，以及看你在有限的时间内和有限的资源内能做多少。没有什么绝对的标准。
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17楼2019-07-13 10:44:54
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欧易 李炼

新虫 (小有名气)
验证个二三十个

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18楼2019-07-13 23:10:32
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FloverYJ

新虫 (初入文坛)
★
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你好，我想请问你做拟南芥转录组测序的时候，送样的时候选择的是是什么样品，就是是土培的苗还是点皿的幼苗，我准备做整株的测序，但不太清楚怎么处理样品，望告知
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19楼2020-07-22 15:42:38
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逆飞翔2楼
2019-07-12 23:57   回复  
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武鑫鑫3楼
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枫香丹墨4楼
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梅影霜天5楼
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fingerlake6楼
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danielzhang7楼
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ansuan20088楼
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晶晶追梦9楼
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jixiangbao10楼
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杜尚别11楼
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请回答201912楼
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111小鸟13楼
2019-07-13 00:03   回复  
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junwei201014楼
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我心窃慕你15楼
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fenghuan2116楼
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