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各位大神,我想问一下转录组测序后得到的差异基因进行blast,然后选出一些基因进行功能验证,我想问一下这些基因的可信度高吗?我做了4个基因,老板说太少,可能转到拟南芥里没表型。我大概要选多少个基因比较合适。
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2019-07-14 21:45:18
楼主选定候选基因的时候不是光看表达差异了吧,至少还得结合gene 功能,通路分析,以及聚类分析的之类吧。
另外,选定了候选gene,一般也都是再跑个qPCR来验证一下RNA-seq的结果,然后再做转gene。毕竟转gene实验周期长,尽量要用多种方法排除那些不靠谱的。
至于四个够不够,主要就是看你的前期结果找到多少,以及看你在有限的时间内和有限的资源内能做多少。没有什么绝对的标准。
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2019-07-13 10:44:54
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你好,我想请问你做拟南芥转录组测序的时候,送样的时候选择的是是什么样品,就是是土培的苗还是点皿的幼苗,我准备做整株的测序,但不太清楚怎么处理样品,望告知
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19楼
2020-07-22 15:42:38
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fenghuan21
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