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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 转录组测序
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承太郎

新虫 (小有名气)
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转录组测序
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各位大神，我想问一下转录组测序后得到的差异基因进行blast，然后选出一些基因进行功能验证，我想问一下这些基因的可信度高吗？我做了4个基因，老板说太少，可能转到拟南芥里没表型。我大概要选多少个基因比较合适。

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1楼 2019-07-12 23:56:20
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TE225

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2019-07-14 21:45:18
楼主选定候选基因的时候不是光看表达差异了吧，至少还得结合gene 功能，通路分析，以及聚类分析的之类吧。
另外，选定了候选gene，一般也都是再跑个qPCR来验证一下RNA-seq的结果，然后再做转gene。毕竟转gene实验周期长，尽量要用多种方法排除那些不靠谱的。
至于四个够不够，主要就是看你的前期结果找到多少，以及看你在有限的时间内和有限的资源内能做多少。没有什么绝对的标准。
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17楼2019-07-13 10:44:54
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