| 查看: 1619 | 回复: 11 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
【求助】GAUSSIAN计算如何分配内存
|
|||
|
1.我的Pentium(R) 4 CPU 3.20GHz ,2G的机器，请教一下GAUSSIAN计算时如何分配内存，才能发挥到计算效率要好一点，我一般是设置%mem=60MW，是不是可以分配得大一点？谢谢 2.还想请教一下当优化一个分子时，如何知道优化的是分子的最佳构型，我一般的做法是在chemdraw里面输入分子的英文名称，生成的结构复制到chem3D里面，保存为pdb文件，再在GAUSSVIEW里面打开，保存为gif文件，再用GAUSSIAN 03里面计算，但是如何得知优化出来就是分子的最佳构型，好像优化跟分子的初始构型关系很大，希望虫友指教，刚接触GAUSSIAN不久，见谅。 我计算的分子是几种常用的季铵盐阳离子表面活性剂，CTAB,CTAC等，或者还有什么好一点建议，谢谢  |
回复此楼» 猜你喜欢
比利时鲁汶大学与国家留学基金委共同资助博士研究生CSC-KU Leuven PhD Scholarship
已经有0人回复
-
量子点电致发光器件（QLED）：蓝光量子点（QDs）和纳米氧化锌电子传输材料
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有216人回复
-
需要一个圆偏振光诱导化学反应，请问使用圆偏振光作为光源，应该需要哪些设备搭建
已经有0人回复
-
伦敦大学学院Benjamin Moss博士招收人工智能、原位光谱、催化相关26年博士生
已经有11人回复
-
中国科学院成都山地灾害与环境研究所2026年特别研究助理（博士后）招聘启事
已经有0人回复
-
求ENDNOTE破解软件安装包
已经有4人回复
-
河海大学 （211.双一流高校）钙钛矿光电实验室丁勇团队欢迎有志青年！
已经有3人回复
-
黑龙江省原子能研究院化学课题组招收2026级化学专业或化学相关专业硕士生
已经有0人回复
-
26博士申请
已经有0人回复
-
调剂
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
S07111072
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 8405.7
- 散金: 9
- 红花: 3
- 沙发: 2
- 帖子: 2048
- 在线: 345.5小时
- 虫号: 491192
- 注册: 2008-01-05
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
2楼2009-05-05 16:13:10
3楼2009-05-05 18:18:01
hairan
木虫 (著名写手)
瞌睡木虫
- QC强帖: 3
- 应助: 61 (初中生)
- 贵宾: 1.06
- 金币: 4974.3
- 散金: 8072
- 红花: 44
- 帖子: 2901
- 在线: 733.4小时
- 虫号: 432069
- 注册: 2007-08-12
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
loovfnd(金币+2,VIP+0):感谢你的参与！ 5-5 19:31
zhumenjun(金币+3,VIP+0):谢谢 5-5 23:59
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 重奖 5-6 08:49
zhumenjun(金币+1,VIP+0):再次感谢 5-14 10:37
loovfnd(金币+2,VIP+0):感谢你的参与！ 5-5 19:31
zhumenjun(金币+3,VIP+0):谢谢 5-5 23:59
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 重奖 5-6 08:49
zhumenjun(金币+1,VIP+0):再次感谢 5-14 10:37
|
这个回复有些误导 貌似lz是在windows下计算，此时不应将内存全部分给计算，至少要留出400M给系统和其他应用软件使用。因此有效的能使用内存的上限应该是1.6G，也就是大概200mw。其实linux下也不要把所有的内存都给了Gaussian，只不过linux系统占用的资源要少得多而以。考虑到gaussian计算的特点（仅限于windows版和标准linux版，不含一些特别编译的版本），如果不能将所有的积分全部放在内存中，那么lz在计算中至多设置你目前60mw，否则每到一个link，系统需要先把你定义的内存吃满再计算，内存设的越大，计算过程反而越慢。 注意，一般也不要小于10mw，太小了，某些计算是无法进行的。 另外，上面的分析只对半经验，HF和DFT计算有效，如果是MP2或者CCSD(T)等电子相关方法，只要体系不是太小，内存是多多益善。 |
4楼2009-05-05 19:10:21
5楼2009-05-05 19:34:30
hairan
木虫 (著名写手)
瞌睡木虫
- QC强帖: 3
- 应助: 61 (初中生)
- 贵宾: 1.06
- 金币: 4974.3
- 散金: 8072
- 红花: 44
- 帖子: 2901
- 在线: 733.4小时
- 虫号: 432069
- 注册: 2007-08-12
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
★ ★ ★ ★ ★
zhumenjun(金币+1,VIP+0):谢谢 5-5 23:59
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 5-6 08:49
zhumenjun(金币+1,VIP+0):谢谢 5-5 23:59
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 5-6 08:49
|
回5楼 Gaussian计算是模块化的，计算过程中不同的任务需要调用不同的模块，这些模块在在Gaussian中就叫做link，如果你细心察看进程，你会发现gaussian计算的时候进程中会有一个"l+一个数字.exe的进程"，比如l502.exe, 这里的"l"就是link的简写字母L，而不是数字1。对标准的gaussian版本，每到一个新的link，程序不管用不用那么多内存，先把你设置的内存量占用了，然后才开始这个link的计算，到下一个link的时候先释放内存，然后重新在占用设置容量的内存。如此反复，直到计算完成，因此很多时候你设置的内存越大，计算反而越慢。 |
6楼2009-05-05 20:03:19
7楼2009-05-05 21:04:59
8楼2009-05-06 00:05:29
9楼2009-05-06 00:20:53
10楼2009-05-06 07:48:02
