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【求助】GAUSSIAN计算如何分配内存
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1.我的Pentium(R) 4 CPU 3.20GHz ,2G的机器,请教一下GAUSSIAN计算时如何分配内存,才能发挥到计算效率要好一点,我一般是设置%mem=60MW,是不是可以分配得大一点?谢谢 2.还想请教一下当优化一个分子时,如何知道优化的是分子的最佳构型,我一般的做法是在chemdraw里面输入分子的英文名称,生成的结构复制到chem3D里面,保存为pdb文件,再在GAUSSVIEW里面打开,保存为gif文件,再用GAUSSIAN 03里面计算,但是如何得知优化出来就是分子的最佳构型,好像优化跟分子的初始构型关系很大,希望虫友指教,刚接触GAUSSIAN不久,见谅。 我计算的分子是几种常用的季铵盐阳离子表面活性剂,CTAB,CTAC等,或者还有什么好一点建议,谢谢 |
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7楼2009-05-05 21:04:59
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这个回复有些误导 貌似lz是在windows下计算,此时不应将内存全部分给计算,至少要留出400M给系统和其他应用软件使用。因此有效的能使用内存的上限应该是1.6G,也就是大概200mw。其实linux下也不要把所有的内存都给了Gaussian,只不过linux系统占用的资源要少得多而以。考虑到gaussian计算的特点(仅限于windows版和标准linux版,不含一些特别编译的版本),如果不能将所有的积分全部放在内存中,那么lz在计算中至多设置你目前60mw,否则每到一个link,系统需要先把你定义的内存吃满再计算,内存设的越大,计算过程反而越慢。 注意,一般也不要小于10mw,太小了,某些计算是无法进行的。 另外,上面的分析只对半经验,HF和DFT计算有效,如果是MP2或者CCSD(T)等电子相关方法,只要体系不是太小,内存是多多益善。 |

4楼2009-05-05 19:10:21












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