| 查看: 8012 | 回复: 5 | ||
[求助]
如何将自己的氨基酸序列转换获得.pdb格式文件 已有1人参与
|
|
小弟最近需要进行蛋白三级结构的模拟建模,使用的软件是pymol、rasmol,但是这两个软件都是识别.pdb格式的蛋白序列文档,有没有大神教教我如何将自己手头上的氨基酸序列(.fasta)转换成可以被建模软件识别的.pdb格式,谢谢 注:1.本人手头上的序列在PDB,ncbi等数据库比对后未找到已有的数据; 2.尝试了使用OpenBABEL进行转换,不知道是哪里没有设置好转换出来的用pymol、rasmol读取后都是直线型,下了一个GFP的.fasta和.pdb作为对照,转换 后也是直线型与直接下的.pdb不一致。 |
» 猜你喜欢
生物质超级电容器
已经有0人回复
ALK5 高选择性小分子 LY-3200882:可放大合成路线与质控要点解析
已经有0人回复
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有291人回复
AM630(CAS 164178-33-0):CB2 选择性配体的实验使用与供应要点
已经有0人回复
ADC标杆分子T-DM1全解析:从结构设计到实验室应用的技术要点
已经有0人回复
HILIC磁珠研究蛋白组学怎么做?
已经有0人回复
His标签蛋白纯化怎么才能快?
已经有0人回复
WRN变构抑制剂HRO761:从D1/D2界面锁定到MSI合成致死的工具化合物深度解析
已经有0人回复
KRAS G12V(ON) 选择性抑制剂 RMC-5127:从三元复合物机制到科研应用
已经有0人回复
SHP2 变构抑制剂 Sitneprotafib:从作用机制到科研试剂选型要点
已经有0人回复
PRMT5·MTA 抑制剂 MRTX1719 的科研应用
已经有0人回复
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-09-22 10:29:48
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-09-22 10:29:48
|
swiss model,同源建模,把你氨基酸序列输入,结果中可以现在pdb文件的蛋白结构文件 发自小木虫Android客户端 |

2楼2018-09-13 12:26:15
3楼2018-09-13 12:32:41

4楼2018-09-13 17:26:26
5楼2018-09-21 08:51:59
6楼2018-09-21 14:31:45










回复此楼