| 查看: 7822 | 回复: 5 | ||
[求助]
如何将自己的氨基酸序列转换获得.pdb格式文件 已有1人参与
|
|
小弟最近需要进行蛋白三级结构的模拟建模,使用的软件是pymol、rasmol,但是这两个软件都是识别.pdb格式的蛋白序列文档,有没有大神教教我如何将自己手头上的氨基酸序列(.fasta)转换成可以被建模软件识别的.pdb格式,谢谢 注:1.本人手头上的序列在PDB,ncbi等数据库比对后未找到已有的数据; 2.尝试了使用OpenBABEL进行转换,不知道是哪里没有设置好转换出来的用pymol、rasmol读取后都是直线型,下了一个GFP的.fasta和.pdb作为对照,转换 后也是直线型与直接下的.pdb不一致。 |
» 猜你喜欢
透明质酸酶的作用机制:如何实现药物递送
已经有0人回复
爱思维尔旗下LWT投稿
已经有9人回复
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有207人回复
替拉扎明为缺氧选择性细胞毒药物研究提供新思路
已经有0人回复
拉坦前列腺素(Latanoprost):前列腺素F2α衍生物如何成为青光眼一线用药
已经有0人回复
卟啉家族中的明星分子:MESO-四(3,5-二溴-4-羟基苯基)卟啉的性质与制备
已经有1人回复
宠物寄生虫防治:氟雷拉纳阻断GABA受体,持效12周驱杀跳蚤蜱虫
已经有0人回复
为呼吸打开通道:依伐卡托的科学之旅
已经有1人回复
Dordaviprone(ONC201):小分子药物在中线胶质瘤中的应用
已经有0人回复
依喜替康:新型喜树碱衍生物的研究进展
已经有1人回复
膀胱癌靶向治疗新选择:厄达替尼作用机制与耐药研究进展
已经有0人回复
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-09-22 10:29:48
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-09-22 10:29:48
|
swiss model,同源建模,把你氨基酸序列输入,结果中可以现在pdb文件的蛋白结构文件 发自小木虫Android客户端 |

2楼2018-09-13 12:26:15
3楼2018-09-13 12:32:41

4楼2018-09-13 17:26:26
5楼2018-09-21 08:51:59
6楼2018-09-21 14:31:45












回复此楼
5